概要 本文主要讨论Seurat对象导入到Monocle中直接进行分析的可行性，分两种情况：①经过数据清洗、标准化和聚类的Seurat对象导入②未...
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实验记录10: 用Monocle进行伪时间分析 -
R数据可视化1: 火山图拖延症让我一直疲于整理qiime2的分析过程。而且手上暂时也没有相应的16S数据要分析，所以打算整理整理R的画图脚本。而且总是百度一些画图细节让...
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实验记录3：用R包Seurat进行QC、PCA分析与t-SNE聚类版本信息： Seurat v2.0不是3.0！现在Seurat更新了3.0版本，下载也是默认的3.0，这篇记录只适用于用2.0的。 梗概 将Ce...
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10xGenomics单细胞转录seurat包提取表达量画小提琴图10xGenomics单细胞转录seurat包提取表达量画小提琴图 需求提取表达画小提琴图对噪音处理 需求 其实seurat包已经有画小提琴图的...
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找出cluster的差异基因并进行GO和KEGG分析
单细胞测序数据经Seurat包tsne降维聚类后，得到cluster，如何找出cluster的marker并进行GO、KEGG分析 需要R包：S...
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celaref ||单细胞细胞类型定义工具Sarah Williams (2019). celaref: Single-cell RNAseq cell cluster labellin...
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scRNA-seq拟时分析 || Monocle2 踩坑教程拟时（pseudotime）分析，又称细胞轨迹（cell trajectory）分析，通过拟时分析可以推断出发育过程细胞的分化轨迹或细胞亚型的演...
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一个超简单的转录组项目全过程--iMac+RNA-Seq（四）featureCounts
好久没更新啦，因为最近没有在跑项目哦，所以就搁置了，最近要做一两张图，所以把前面写的教程先发布一下~ 前期文章 一个超简单的转录组项目全过程--...
专题公告
转录组学分析
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