topGO是一个半自动的GO富集包,该包的主要优势是集中了好几种统计检验的方法,目前支持的统计方法如下: 一、安装 BiocManager::i...
![240](https://upload.jianshu.io/collections/images/1902567/crop1596171811457.jpg?imageMogr2/auto-orient/strip|imageView2/1/w/240/h/240)
topGO是一个半自动的GO富集包,该包的主要优势是集中了好几种统计检验的方法,目前支持的统计方法如下: 一、安装 BiocManager::i...
现在的社会正处于大数据时代,生物学研究领域也迎来了大组学时代。无论是植物。动物,还是微生物,都有许多物种被测序。在后续的个性化分析过程中,通常会...
1.使用clusterProfiler包进行GO富集分析使用clusterProfiler的enrichGO函数来获取GO分析 gene就是差异...
library(DESeq2) library(ggplot2) #library(ggrepel) raw.data1<-read.table...
菜🐣的第一次正式上手R,相当于翻译了 edgeR 这个包的 UserGuide,跑了第一个 case眼看写了这么多字,还是发一下比较好,万一有人...
前面给大家介绍 ☞【R绘图】散点图+直方图(密度图)[https://link.zhihu.com/?target=http%3A//mp.we...
参考文章:https://www.jianshu.com/p/07ae1fe18071需求描述:我想绘制差异表达基因在染色体上的分布,或开放染色...
测序深度的分布图是很常见的一类图,可用于发现染色体片段或整条染色体的缺失或是重复。如果是缺失,测序时捕获的概率就小,最终比对呈现出来的就是有...
有两种方法,先看比较简单的一种: 结果: 第二种方法就比较复杂了,需要准备两个文件:一个是包含染色体长度的文件chr_length.txt...
之前有一次,我导说“能不能把这些基因按顺序画在果蝇的染色体上”,因此,我寻找了一些实现这个需求的方法。经过一番奇奇怪怪的操作之后,最终用ggpl...
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R基本操作