比较基因组分析,首先需要选定要比较的物种,然后下载这些物种的基因组数据。 基因组数据准备 数据准备1.基因结构注释文件, gff/gtf格式2....
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MITOS2可用于注释后生动物以及真菌等线粒体基因组注释,主要注释线粒体18个核心基因(atp6 atp8 atp9 cob cox1 cox2...
R语言里的数据框,约等于表格。比表格多一个要求就是一列只允许一种数据类型的存在。 需求 将数据框最后一列放到第一列的位置,形如: 方法一.bas...
二代数据组装 构建contig:将所有小片段打成K-mer构建de Bruijn图,然后会根据给定的参数对de Bruijn图做一些化简,最后连...
这里是佳奥!经历了一个学期,做了几遍转录组,感受颇深。 原理没变,方法没变,但是思维需要转变,我们需要时刻保持清醒: 做自己的项目不再是机械的重...
题目:对DEseq2差异分析得到的差异基因进行GO富集。 目的:旨在对基因和蛋白质功能进行限定和描述的。 内容:1. 下载GO注释背景文件,准备...
TBtools 的热图功能与Circos图功能类似,属于我开发绘图引擎JIGplot时的副产品。但是呢,估摸着 TBtools 可能是目前湿实验...
前两日,收到了Qianghua小师弟投稿的新插件以及插件制作讲解视频。感觉很不错。 关于插件 BEDtools Intersect GUI Si...
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