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收录了7篇文章 · 1人关注
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    【ATAC-Seq 实战】三、比对与Peaks Calling

    这里是佳奥!我们继续clean数据的比对。 1 使用bowtie2进行比对 用bowtie2进行比对和统计比对率, 需要提前下载参考基因组然后使...

    1.5 佳奥 1 9
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    基因结构注释

    基因结构注释的方法包括: 从头预测根据基因结构的特征,基于算法(大多为隐马尔可夫模型)进行预测 蛋白注释根据物种自身(或近源物种)的蛋白序列,进...

  • 自学Python爬虫:Python lxml解析库实战

    通过编写一个简单的爬虫程序,进一步熟悉 lxml 解析库的使用。使用 lxml 库抓取猫眼电影 Top100 榜:下面直接上代码: 执行结果如下...

  • 【ATAC-Seq 实战】一、分析流程

    这里是佳奥!我们又开始了新的分析流程学习。 与ChIP-Seq相似,ATAC-Seq也是通过染色质片段来进行表观相关的分析。 我们先来看一下分析...

    0.6 佳奥 2 7
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    【ATAC-Seq 实战】五、peaks、motif注释

    这里是佳奥!新的一年,ATAC-Seq的学习也进入了尾声。 让我们开始吧! 1 peaks注释 统计peak在promoter,exon,int...

    1.8 佳奥 0 15
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    GO富集分析

    数据来源表达量差异分析的表格,需要log2(foldchange),Pvalue,FDR 上下调基因筛选,上调基因筛选条件log2(foldch...

    1.5 小qqq 0 6

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