比较基因组分析,首先需要选定要比较的物种,然后下载这些物种的基因组数据。 基因组数据准备 数据准备1.基因结构注释文件, gff/gtf格式2....
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这里是佳奥!我们继续clean数据的比对。 1 使用bowtie2进行比对 用bowtie2进行比对和统计比对率, 需要提前下载参考基因组然后使...
基因结构注释的方法包括: 从头预测根据基因结构的特征,基于算法(大多为隐马尔可夫模型)进行预测 蛋白注释根据物种自身(或近源物种)的蛋白序列,进...
通过编写一个简单的爬虫程序,进一步熟悉 lxml 解析库的使用。使用 lxml 库抓取猫眼电影 Top100 榜:下面直接上代码: 执行结果如下...
这里是佳奥!我们又开始了新的分析流程学习。 与ChIP-Seq相似,ATAC-Seq也是通过染色质片段来进行表观相关的分析。 我们先来看一下分析...
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