前言 DNA 甲基化在许多细胞进程中扮演重要的角色，例如胚胎发育、基因印迹、X 染色体失活和维持染色体稳定性。 在哺乳动物中，DNA 甲基化很少...
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TCGA 数据分析实战 —— 差异甲基化区域模体分析 -
TCGA甲基化数据质量控制和差异分析（使用ChAMP包）参考文章：1.甲基化芯片入门学习-ChAMP包（二）2.TCGA数据库的癌症甲基化芯片数据重分析3.TCGA甲基化芯片数据质控和过滤4.甲基化芯...
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生信 | ATAC-Seq基础分析+高级分析+多组学分析写在前面 其实很多作者已经探索的差不多了，相关脚本、教程也很多，但我还是自己系统的总结一下吧。有时候感觉是浪费时间，但是在写的时候能发现并学习到...
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R语言 -- 寻找差异甲基化区域（DMR）-- DSS 包
最好的文档其实还是官方文档。。。http://bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/...
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scATAC分析神器ArchR初探-使用ArchR识别标记峰（11）scATAC分析神器ArchR初探-简介（1）[https://www.jianshu.com/p/90ccb3d24322]scATAC分析神...
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第一篇SCI这是一篇纯生信的3.5分文章，主要涉及的是小RNA: phasiRNA。小麦的基因组前两年才发表，而类似的研究以前在水稻中做过比较多，因此对于做...
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TCGA甲基化芯片数据质控和过滤在step1中，我们获得了TCGA中OSCC 的32个病人的T-N配对样本和对应的临床信息,并将其组成了一个名为my_Load的ChAMP对象。...
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TCGA甲基化芯片数据的差异基因的生存分析与富集分析4.将差异甲基化位点拿来做批量生存分析 logrank test批量生存分析 这里和TCGA系列里的内容是一样的，详见：两种方法批量做生存分析 ...
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「文献01」ATAC-pipe: ATAC-seq分析的工具包日期：2019年1月6日——2019-Week1分类：「工具」题目：ATAC-pipe: general analysis of genome-...
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全基因组甲基化分析-基本流程图http://www.biomarker.com.cn/technology-services/methylation
专题公告
收集各种甲基化文章，工具
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