官方手册（2020 Sep更新）https://github.com/FelixKrueger/Bismark/tree/master/Docs...
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Bismark Bisulfite Mapper学习笔记（一）数据预处理 -
叶绿体基因组基因、外显子、内含子、基因间隔区提取
Bioinformatic_Scripts/extract_sequences_from_gb_files 一、用途 从注释好的gb格式（Gen...
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叶绿体基因组注释软件PGA使用说明
PGA-Plastid Genome Annotator[https://github.com/quxiaojian/PGA] Qu X-J, ...
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基因组组装和注释理论基因组组装 1.k-mer 那么我们首先要看一下k-mer是什么。它的定义是：是指将一条序列分成包含k个碱基的子字符串，如果reads长度为L，...
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教程 | 使用 CPGAVAS2 进行叶绿体基因组注释写在前面 前述，介绍了使用 GetOrganelle 软件进行植物叶绿体基因组组装。测试了下软件，130个样品，直接成环的有76个。手动调整了参...
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教程 | 简单粗暴的叶绿体基因组 SNP Calling 流程写在前面 最近主要忙一些植物群体基因组数据的项目。前面提过，赶时间，全基因组的 SNP Calling 使用 GATK 流程，还是需要跑上两三天...
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零基础教程 | 叶绿体基因组组装 - GetOrganelle关键词：零基础；叶绿体基因组；神器；国人佳作；一键成环。软件官网：https://github.com/Kinggerm/GetOrganell...
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叶绿体基因组组装软件NOVOPlasty使用简介
NOVOPlasty 是一个perl脚本，没有依赖任何其他软件，下载好以后直接可以使用。下载链接https://github.com/ndier...
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七. 植物叶绿体基因组--组装，注释和比较作图（GetOrganelle，GeSeq，Chloroplot，IRscope）一. 简介 叶绿体是绿色植物，藻类和蓝细菌进行光合作用的场所，光合作用将水和二氧化碳转变为有机化合物并放出氧气。叶绿体所携带遗传物质DNA，以原...
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线粒体和叶绿体基因组的组装、注释
组装 GetOrganelle主要用于组装各种质体（叶绿体、线粒体）GetOrganelle github[https://github.com...
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