【CIBERSORT】超详细，从数据下载到数据分析全过程(初学者笔记) cibersort是目前引用次数最多的免疫细胞浸润估计分析工具，2015...
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【CIBERSORT】超详细，从数据下载到数据分析（初学者笔记） -
GEO数据分析中exprs提取表达矩阵，pData提取临床信息
关于用getGEO下载数据后，会得到一个list，取出第一个列表中的元素后，再查看这第一个元素的数据类型后，发现他是一个对象（"Expressi...
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复现：纯R代码实现ssGSEA算法评估肿瘤免疫浸润程度最近学习了生信菜鸟团的纯R代码实现ssGSEA算法评估肿瘤免疫浸润程度,想复制作者的流程，但是发现了几个不一样的地方，所以重新整理流程，代码主要...
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CIBERSORT 免疫浸润(2023.1.2更新版)目前主流的免疫浸润计算方法是CIBERSORT和ssgsea，今天介绍CIBERSORT。 1.输入数据要什么 下面这段话摘自CIBERSORT...
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基于Seurat结果推断单细胞群肿瘤纯度之ESTIMATEInferring tumour purity and stromal and immune cell admixture from expre...
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肿瘤免疫浸润细胞在线分析---Cibersort做肿瘤方向的同学们，现在CAR-T，PD1，TIL治疗这么火热，要不要试试你研究的肿瘤类型，是不是也涉及免疫细胞浸润？不需要复杂的代码，网页工具...
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定量免疫浸润在单细胞研究中的应用最近听说定量免疫浸润很火，于是我也报名参加了果子老师的课程，跑了几个R包，你比如说xCell啊，GSVA啊，MCPcounter啊，Consen...
专题公告
Cibersort
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