注:本文全文摘选自知乎:fastp: 一款超快速全功能的FASTQ文件自动化质控+过滤+校正+预处理软件 1引言 各位做生信的小伙伴都知道,对于...
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刘小泽写于19.10.28 相信大家都遇到过,这个烦人的loading~ 这是因为IGV的设计者默认全球都能访问他们的网站,但是,广大的国内用户...
之前分析过的测序数据,数据质量都很好,给了我一个错觉质控的前后差别不是很大,内心里对质控这一步也就不是很重视,跑完质控有时也懒得看结果,拿到一批...
BWA[http://bio-bwa.sourceforge.net/] (Burrows-Wheeler Aligner) BWA主要是将re...
Samtools和Bcftools简介 SAMtools是一个用于操作sam和bam文件的工具合集,包含有许多命令。BCFtools主要是用来操...
Samtools常用命令的总结【samtools强大工具的几个功能】 内容来自一下网址,感谢原作者。不是盗版,记录仅用于个人学习,有笔记可寻!!...
参考文章:https://www.cnblogs.com/xiaofeiIDO/p/6805373.html1、view主要功能:sam和bam...
必须学习这篇英文:http://www.htslib.org/doc/samtools.html【继续更新ing】 samtools view ...
SAM(sequence Alignment/mapping)数据格式是目前高通量测序中存放比对数据的标准格式,当然他可以用于存放未比对的数据。...
Source: https://blog.csdn.net/Longyan_sysu/article/details/52184628作者:龙炎...
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