数据库背景介绍 TCGA，全称：The cancer genome altas官网：https://cancergenome.nih.gov/[https://cancerg...
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2021-04-29 TCGA与GTEX数据下载 -
bedGraph，bed以及bam文件格式转换
感兴趣的基因信息包含在bedGraph文件中，下面命令是对其文件格式进行转换，一般进行到bam文件可视化的效果比较好。 1. bedGraph转bed文件 BedGraph ...
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RNA-seq 分析流程 —— 概述前言 接下来我们要介绍的是 RNA-seq 数据的处理分析流程，根据 RNA-seq 测序技术的不同，可以分为三种： short-read long-read direct ...
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文献阅读：细胞异质性的表观遗传学基础这篇文献是今年的11月发表在Nature reviews上的一篇综述，题目是The epigenetic basis of cellular heterogeneity。主要...
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如何利用单细胞测序研究乳腺发育分化
乳腺上皮细胞（mammary epithelial cells，MECs）结构特征以及发育过程中如何受到调控，对于理解乳腺癌发生至关重要。 本研究利用单细胞转录测序（Sing...
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RNA-seq 数据分析最佳实战（综述）知识的学习没有一蹴而就，没有捷近，扎实的学习是唯一的捷近。 一篇RNA-seq分析流程的综述，全面而详细！深度好文，可用来反复阅读。初学者用于把握RNA-seq真个流程及各个...
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deepTools 使用指南deepTools 是一套基于python开发的工具，适用于有效处理分析高通量测序数据，可用于ChIP-seq, RNA-seq 或 MNase-seq。 #1. deepT...
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ChIP-seq实践（非转录因子，非组蛋白）在实战之前，首先对CHIP-seq分析做一些了解，以下是从各个地方copy过来综合起来的，有些散乱，是我认为重要以及应该了解的知识点。chip-seq 实战就跟在转录组和外显...
