文章标题:CheckM2: a rapid, scalable and accurate tool for assessing microbial genome qualit...
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第一部分 自习室网络出奇的差,有时想打开NCBI网页下载文件时会一直在那里转圈圈,本来很简单的一件事有时却要浪费好长时间;恰好最近在学习 Bioinformatics wit...
安装时间:2021.2.19 1. 简介 ncbi-genome-download是一个可以直接从NCBI上批量下载序列的软件,支持下载多种格式。 2. 安装 利用conda...
第一步安装软件 第二步转到工作目录 第三步,拼装序列 第四步,导出输出文件
【NCBI编号】NCBI中编号/编码说明 在日常分析中,我们在NCBI数据中常常见到AC、NC、NM、NR、NP、NG等各类编号,这类编号分别代表着怎样的含义?我们该如何根据...
开个帖子整理一下自己的生信学习笔记目录,方便日后查看:最近更新:2022.07.03 bulk RNA-seq: 实战系列: RNA-seq入门实战(零):RNA-seq流程...
单个基因集的GSEA分析 http://software.broadinstitute.org/gsea/msigdb/index.jsp GSEA官网列出关于msigdb基...
GSEA(Gene Set EnrichmentAnalysis),即基因集富集分析,无需设定阈值来区分上调下调基因,使用所有的基因进行分析。 GSEA分析只需要两列信息,基...
****今天来关注如何使用clusterProfiler系列包来分析GSEA** 导入包,导入数据 今天比昨天多导入了一个ReactomePA包,这个包也是Y叔开发用来分析R...