其实不论是PCoA还是PCA图均是用散点图来展示结果PCoA和PCA的结果,PCoA和PCA准确来讲是数据降维分析方法。顺便值此佳节,祝福各位和“科研”都能够拥有幸福时光和美...
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参考链接:https://github.com/velocyto-team/velocyto.R[https://github.com/velocyto-team/veloc...
生信星球 打卡第一天 1.甲基化知识 DNA甲基化是表观遗传学领域一个重要的研究方向,真核生物中最常见的DNA修饰非5-甲基胞嘧啶(5mC)莫属了,然而在原核生物中最常见的D...
刘小泽写于18.7.17所有的数据,一旦要找变异位点信息,就离不开VCF。豆豆也是在写一个重测序的操作流程,遇到了VCF文本,之前也是没有了解过,这次再多学一个格式官方最新说...
写在前面的废话 我可能不适合做科研,因为我总是对一些“没有必要”的事斤斤计较~ 刚开始接触二代测序时,是跟着Jimmy大神从RNA-seq开始入门的。那时候使用的比对工具是H...
SCENIC全称:Single-Cell rEgulatory Network Inference and Clustering实战之前需要准备的学习资料:1.阅读关于SCE...
参考: 第六章 scRNA-seq数据分析 使用monocle包进行pseudotime分析 monocle2 官方教程 单细胞转录组学习笔记-18-scRNA包学习Mono...
前言 我们知道,细胞间信息传递方式一个是细胞表面配受体的相互作用,另一个通过细胞产生的可溶性小分子,即细胞因子。在单细胞数据分析中下游,有时候我们想看某几种细胞类型之间的相互...
随着转录组技术的发展,空间转录组已经正式走向商业化时代,作为单细胞数据分析的工具箱的Seurat与时俱进,也相应地开发了空间转录组分析的一套函数,让我们跟随卑微小王看看Seu...