以上报错可能与根的位置有关系 在a,b两边加括号可解除，原因暂时不明确
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请教一下作者，我要做不同门的几个物种之间的基因家族扩张与收缩分析，对变异较大的基因家族过滤后再按照您的方法将λ值改为0.0001，但还是报错You may want to try removing the top few families with the largest difference between the max and min counts and then re-run the analysis.请问有什么解决方法吗？
比较基因组学分析2：基因家族收缩与扩张分析
比较基因组学分析目录 1：单拷贝基因构建物种树以及计算分化时间[https://www.jianshu.com/p/10bb4410ae3d]2：基因家族收缩与扩张分析[ht...
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绘制 SNP 密度图一般使用 CMplot 绘制SNP密度图：包链接：https://github.com/YinLiLin/R-CMplot 要绘制 SNP 密度图，仅仅需要三列即可：a. 第...
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你好我对13个物种进行分化时间估计，提取到的4dtv位点只有172个，之后在用mcmctree运算时得到的接收比例第五列总是大于70%：36% 0.30 0.35 0.31 0.31 0.77，请您指教，是我的4dtv位点数太少了吗。
mcmctree估算物种分歧时间
推断物种系统发育关系以及分歧时间对探讨物种起源与演化具有重要意义。通过最大似然法（ML）构建物种进化树以及估算物种分化时间在比较基因组学的研究进展中已经成为了必不可少的“套路...
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卑微植物方向生信狗，从头开始学起。<br>研究生奋斗1000天计划进行中——
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个人博客: xuzhougeng.top (随缘访问)
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研究生，常做实验，生信小白。
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是在linux子系统下操作的，软件是conda下载的，之前运行过一次显示是成功的，但是后来怎么运行都会报这个错误
Aspera数据下载快速应用
本来下载数据用的是NCBI官方指定的sratool-kit里面带的prefetch，本来实验室网速快还没啥问题，但是这次碰到了一个硬茬，压缩后数据15G，下载数次中断，后来转...
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你好我用aspera下载ena数据库的数据的时候出现Session Stop (Error: Session data transfer timeout)
Aspera数据下载快速应用
本来下载数据用的是NCBI官方指定的sratool-kit里面带的prefetch，本来实验室网速快还没啥问题，但是这次碰到了一个硬茬，压缩后数据15G，下载数次中断，后来转...
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请问第四步里的spinach_pep_v1.fa是什么文件
Augustus 基因从头预测
目前的从头预测软件大多是基于HMM(隐马尔科夫链)和贝叶斯理论，通过已有物种的注释信息对软件进行训练，从训练结果中去推断一段基因序列中可能的结构，在这方面做的最好的工具是AU...
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Seurat 4.0 ||单细胞数据分析工具箱有更新随着单细胞技术的成熟，同一细胞内的信息越来越多被揭晓。在转录组时代，我们说单细胞是一个rna的盒子，细胞类型是基因特异性表达的结果。现在，我们可以说单细胞是中心法则的反应器，...
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生信技能树，生信菜鸟团，jimmy
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周运来，男，长大了才会遇到的帅哥，稳健，潇洒，大方，靠谱。一段生信缘，一棵技能树。生信技能树核心成员，单细胞天地供稿人，简书创作者，单细胞数据科学家。
