懂得了那么多道理,却依然过不好这一生。 所以理论归理论,最终要落实到分析代码上,咱们从这一篇开始,介绍一套扩增子数据分析流程。 闲话少叙,首先介绍一下项目背景: 测序平台: ...

IP属地:海南
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简介 Seurat是一个r包,被设计用于单细胞rna-seq数据的细胞质控和分析。Seurat旨在使用户能够识别和解释单细胞转录组数据中的异质性来源,同时提供整合不同类型...
作者 | Arno审稿 | 童蒙编辑 | amethyst 上一期我们介绍了ATAC-seq相关的背景知识。ATAC-Seq能帮助我们从全基因组范围内推测可能的开放染色质位点...
解释任何单细胞测序数据的起点都是对给定数据集中的细胞簇进行注释。由于缺乏专门设计的工具以及在单细胞ATAC-seq数据中使用不直观的顺式和跨式调控元素(unintuitive...
虽然是做生物信息的,但是经常被一些基础性概念所困扰……而我又是一个强迫症,于是把这些乱七八糟的东西整理了一下,强行写了一篇小文章。东西太杂,但是彼此相关,实在想不到什么合适的...
在四周之前,我写了一篇推送一个月能通过转录组入门生信吗?,于是开启了我的‘四周通过实战入门转录组’计划。现在四周结束了,我对这个计划进行一个阶段性的总结。 答疑解惑 首先要感...
写在前面: 来自生信技能树《生信必修课之软件安装》学会用包管理工具安装软件 普通安装和配置,请看这篇Linux下bowtie2安装(非conda)和配置 注意 现在清华镜像源...