Global characterization of T cells in non-small-cell
lung cancer by single-cell sequencing 张泽明老师的文章
复现一篇文章前言 此复现过程全程由kinesin老师指导，过程有点复杂，如发现问题，请及时简书联系我，我及时更改,主要复现标准化免疫细胞组成的生存分析。 下载数据 免疫分析 整理原文基因...
发简信
IP属地：广东
-
go kegg我用的差异基因 gsea gsva我用的所有基因排序
单细胞的GO KEGG GSEA GSVA分析
今天抽个空把单细胞领域的GO KEGG GSEA GSVA都做了一遍，跑完以后的感觉就是有这样的理解，就是单细胞我首先会选择做GSVA，但是我还会顺便做下kegg或者GSEA...
-
单细胞分析揭示iCAF亚群在膀胱癌治疗中的靶标作用
作者：biogevin审稿：童蒙编辑：amethyst 我们在前面已经介绍过膀胱细胞的相关背景（认识膀胱细胞——单细胞水平比较Human和Mouse的不同[http://mp...
-
@Seurat_ 需要的
单细胞scenic做转录因子
scenic从接触到现在有三个月了，从当初的懵懂到后来的服务器，感谢kinesin老师指导，但是总归scenic跑崩溃了很久，可以把人心态搞崩溃，但我觉得两个地方可以改进，可...
-
@路麻麻_c96a 差异分析 logfc
第三步：简单的GEO数据的KEGG分析和GSEA分析
KEGG分析 按照count数目进行KEGG count数目进行kegg,并且可视化 GSEA分析 GSEA与KEGG不同的是，GSEA是所有基因的增减，而kegg是争对 上...
-
膜拜 太强了harmony
用Harmony整合单细胞数据并用LISI评估整合效果
harmony是一个非常流行的整合单细胞数据的算法，由于它的核心是用C++写的所以相比其他的类似算法快很多，如果单细胞样本量很大的时候推荐使用。 首先加载其文章中用到的一个示...
-
@晓颖_9b6f 你需要么 可以私信我 我发给你 自己写的
第三步：简单的GEO数据的KEGG分析和GSEA分析
KEGG分析 按照count数目进行KEGG count数目进行kegg,并且可视化 GSEA分析 GSEA与KEGG不同的是，GSEA是所有基因的增减，而kegg是争对 上...