您好！有同样的问题，请问您解决了吗？
《BSA》-生信笔记---003背景介绍 一、什么是BSA? BSA（Bulked Segregant Analysis）---混合分组分析法 >根据目标性状表现型，对表型分离群体中的个体/株系依据目标性状...
IP属地：上海
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您好！请问bwa比对后不需要去除PCR重复吗？谢谢！
环状DNA (eccDNA)分析学习笔记
最近在学习当下很火的环状DNA（eccDNA）的建库技术以及生信分析，特此记录。 No.1 去低质量&去接头 这一步需要注意的是低质量碱基的quality cutoff, 2...
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请问鉴定到一些tagSNP后，一般用于后续的什么操作呢？这个和leadSNP又是不同的概念，在plink.tag.list文件中的这个区间是什么意义呀，可以理解为LD block吗？小白，问题可能有点奇怪，非常感谢！
Plink提取tagSNPs
Plink提取tagSNPs 1）识别haplotype block 在提取tagSNPs之前需要先识别haplotype block，这一步的代码很多教程里都给了出来： p...
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群体遗传 || Pophelper-群体结构可视化学习
Pophelper基本说明 群体遗传下游分析中的一项常规分析即是群体结构的分层展示(STRUCTURE ANALYSIS)，不同于系统树和PCA，群体结构分层可以分断出小群体...
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感谢楼主分享！请问楼主为什么.Q文件的最后一列要去掉呀？第一次做GWAS分析，好多都不懂。。。我跑完MLM后所有位点的p值都大于0.01，不知道什么原因。
跑通GWAS，用这些脚本就够了
最近跑通了一遍GWAS分析，全程在linux操作，虽然具体还有好多需要微调的地方，先把代码整理分享出来mark一下 前期准备 1.理论知识 强烈推荐百迈客云课堂课程GWAS生...
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请问怎么把source加载的GAPIT的两个文件保存为.R文件呢？谢谢~
【GWAS】GAPIT使用教程
GAPIT（genome association and prediction integrated tool）华盛顿大学等于 2012 年开发的软件（软件主页：http:/...
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Week4— chromVAR:预测染色质可及性相关的转录因子第四周 2018— 06.11-06.17原文： chromVAR: Inferring transcription factor-associated accessibil...
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ATAC-seq生信分析综述翻译(Genome Biology)这是目前为止我看到过的关于ATAC-seq的最新综述，感兴趣的话值得一读。2020.4.22更新：我看到一个公众号也翻译了这篇文章，而且正好跟我这篇翻译是在同一天发表http...
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转录组学习七（差异基因分析）
转录组学习一（软件安装） 转录组学习二（数据下载） 转录组学习三（数据质控） 转录组学习四（参考基因组及gtf注释探究） 转录组学习五（reads的比对与samtoo...
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基因组和转录组组装质量评估利器BUSCO（以大肠杆菌基因组质量评估为例）基因组和转录组组装质量评估利器——BUSCO（Benchmarking Universal Single-Copy Orthologs） 一，BUSCO简介 该软件利用Ort...
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