串联法和并联法构建进化树 串联法(Concatenation)：先将不同物种之间的每个单拷贝基因单独进行多序列比对，然后将这些比对后的单拷贝基因进行首尾相连串接成一个supe...
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串联法和并联法构建进化树
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R包clusterProfiler: 转换ID、GO/KEGG富集分析参考这篇ID转换不用怕，clusterProfiler帮你忙这篇详细讲了无参考基因组该怎么办，值得一看 简单介绍一下几种常用的ID：Ensemble id：一般以ENSG开头...
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「GO富集分析」从原理到实践 ~ 零基础掌握写在前面 原本，我并无写这一稿件的想法。主要原因有二： 网络上已有相关资料较多，尽管类似的问题天天仍然有人问 再谈起 GO富集分析，距离上次已是五六年，简单来说，不想谈 如果...
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随笔 | 做一个“有情怀”的人 - 关于软件开发和日常琐事
想来想去，倒是可以记录一下最近的一些事件和思考。 删了一行代码，功能加速 100 倍 写代码也有好几年了，尽管是业余工作，但多少还是有一些提升。肉眼可见的是，开发速度明显下降...
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关心一下你的研究材料？农林牧渔~写在前面 很多时候，我们会看到一些文稿，上来就是“我研究的物种如何如何重要”。其中，最有说服力的，或许就是，基于“FAO STAT”，品类产量几何几何。以前，我也不多关注这个...
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20个转录组基本知识点
随着测序成本的不断下降，转录组测序分析已然成为生物学及医学研究不可或缺的技术手段。 重点介绍一下转录组测序分析的相关知识。 Question and Answer 1、什么是...
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TBtools | 开箱须知写在前面 最近可能是不少人要赶毕业论文，于是找上了 TBtools，并急急忙忙希望解决自己的问题。于是，他们总是会在群里 @我 或者 @管理员。事实上，这是一个违背群约定的事...
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木薯抗性NBS基因家族分析
虽然我们一直在说可以“用别人的数据，写自己的文章”，但是具体怎么操作，很多同学还是不清楚。今天就用一个完全用公共数据库资源进行分析发文的例子来和大家分享下这方面的思路。 读前...
