1. 基因家族聚类 基因家族是来源于同一个祖先,由一个基因通过基因重复和物种分歧而产生两个或更多的拷贝而构成的一组基因,它们在结构和功能上具有明显的相似性,编码相似的蛋白质产...

1. 基因家族聚类 基因家族是来源于同一个祖先,由一个基因通过基因重复和物种分歧而产生两个或更多的拷贝而构成的一组基因,它们在结构和功能上具有明显的相似性,编码相似的蛋白质产...
由于可变剪切一个基因得到好多个序列长度不同的转录本,应该挑选出序列最长的最长转录本作为数据的分析 看一下有规律的蛋白文件命名,一般是以下形式 写个脚本提取 使用TransDe...
比较基因组分析,首先需要选定要比较的物种,然后下载这些物种的基因组数据。 基因组数据准备 数据准备1.基因结构注释文件, gff/gtf格式2.蛋白序列文件,fasta格式3...
一、OrthoFinder 及 聚类结果统计作图 在比较基因组学研究中,直系同源基因(Orthologs)的鉴定是揭示物种进化关系、基因功能分化的基石。然而传统工具如 InP...
在线工具 OrthoVenn2 使用笔记 文字转自:https://www.sohu.com/a/338678088_652735 全基因组直系同源基因簇(Orthologo...
随着基因组测序爆炸性增长,比较基因组学已逐渐成为每个物种尤其是首次被破译基因组的物种的必备研究内容之一。那么什么是比较基因组学呢?比较基因组学是通过对系统发育中的代表性物种之...
比较基因组学分析目录 1:单拷贝基因构建物种树以及计算分化时间[https://www.jianshu.com/p/10bb4410ae3d]2:基因家族收缩与扩张分析[ht...
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参考此网站改善的:https://www.jianshu.com/p/a23d6f1226a1 ## 这个比较简单好用。 ## 第一步 cd /datapool/gesong...