之前对R语言和Linux是没有一点基础，所以详细记录怎么入门以及如何使用。R语言应用很广，知识很多，生信分析主要常用哪些知识，牢牢掌握那些知识点且应用熟练。
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【生信】格式转换：转成bed及bed12格式
基因组注释gtf文件或bed6文件转bed12文件 上一篇详细介绍了bed格式，尤其清楚的解释了bed格式中的最后三列，这三列对于理解bed12格式转换至关重要。 本文主要介...
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谢谢大佬！
表达矩阵的合并
刘小泽写于2018.8.20利用htseq-count、featureCounts等定量软件生成的counts计数文件都是单独的，后续进行统计需要将它们汇集到一起 实例测试（...
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表达矩阵的合并刘小泽写于2018.8.20利用htseq-count、featureCounts等定量软件生成的counts计数文件都是单独的，后续进行统计需要将它们汇集到一起 实例测试（...
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作者，你好，我在用myobj <- methRead(file_list,sample.id=list("test1","test2","contr1","contr2"),assembly="M.musculus",treatment=c(1,1,0,0)) 命令的时候出现了Error in `[.data.frame`(data, , 5) : undefined columns selected这样的报错？请问你遇到过这样的问题吗？
methylKit 进行差异甲基化分析
methylKit 是一个用于分析甲基化测序数据的R包，不仅支持WGBS，RRBS和目的区域甲基化测序，还支持oxBS-sq, TAB-seq等分析5hmc的数据。 其核心功...
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作者，你好，我在用myobj <- methRead(file_list,sample.id=list("test1","test2","contr1","contr2"),assembly="M.musculus",treatment=c(1,1,0,0)) 命令的时候出现了Error in `[.data.frame`(data, , 5) : undefined columns selected这样的报错？请问你遇到过这样的问题吗？
methylKit 进行差异甲基化分析
methylKit 是一个用于分析甲基化测序数据的R包，不仅支持WGBS，RRBS和目的区域甲基化测序，还支持oxBS-sq, TAB-seq等分析5hmc的数据。 其核心功...
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你好，我想问一下你有没有遇到过在用bsseq处理数据时，数据带有NA，进而到BSmooth.tstat这一步没办法进行的现象？如果有的话，我能问问您是怎么解决的吗？
bsseq 进行差异甲基化分析
