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本次配置的环境是Linux版本的R studio server。直接install_github("jmzeng1314/AnnoProbe")安装出现installatio...

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@ACh_20d2 根据提供的教程，应该是cor_dist
#' Generates a distance matrix using the square root of (1 - spearman).
#'
#' @param dat.mat Matrix of data (features X samples).
#' @return Distance structure.
#' @export
cor_dist <- function(dat.mat) {
dist.mat <- as.dist(sqrt(1 - cor(dat.mat, method = 'spearman')))
return(dist.mat)
}

基于单细胞测序的蛋白活性推断（PISCES）分析流程笔记，凎！

写在前面 感谢califano-lab[https://github.com/califano-lab]团队将代码无私的分享出来=。=！ 本流程需要一点点R语言与linux基...

喂鸡组的阿翔

7408 14 20

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请问各位大佬，“RegProcess('pisces-1-net-final.tsv', mat1, out.dir = 'tutorial/', out.name = 'pisces-1-net-')” 这里的mat1是不是 pisces1 <- readRDS('pisces-clust_aracne-mats/pisces-1-arac.rds')？。如果是，在运行过程中连续出现WARNING! NOT CONVERGENT! number of iterations= 1000 是哪里出了问题？

基于单细胞测序的蛋白活性推断（PISCES）分析流程笔记，凎！

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