文章信息 文章题目：Emergence of a novel conjugative hybrid virulence multidrug-resistant plasmid...
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文章解读丨肺炎克雷伯菌ST15的新型毒力耐药杂合质粒p17-15-vir -
25°C vs 37°C，谁更毒？大蜡螟模型揭开马尔尼菲双相真菌的毒力真相研究背景与核心问题 马尔尼菲蓝状菌（Penicillium marneffei，旧称马尔尼菲青霉）是青霉属中唯一已知的双相性致病真菌，也是中国南方及东南亚地区最致命的机会性真...
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一文读懂国内肺炎克雷伯菌ST11-CRKP流行谱系的发展最近，我们在肺炎克雷伯菌分析项目中发现，ST11菌株中KL25型所占比例似乎相对较高。为确认这一情况，我们对ST11型碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌（CRKP）的相关文献进行了梳理...
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【文献速递】大蜡螟 Galleria mellonella：生物学特性、免疫机制及其在免疫学研究中的模型应用文章信息 文章题目：The greater wax moth Galleria mellonella: biology and use in immune studies 原...
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谈谈如何理解进化树上的 Bootstrap 值摘要 在分子系统学研究中，Bootstrap法被广泛用于评估进化树分支的可靠性。然而，学界常将其数值误解为分支“真实性”的后验概率。本文旨在厘清Bootstrap值的统计学本...
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肺炎克雷伯菌的分型和克隆传播第一部分：肺炎克雷伯菌的分子分型 1.1 多位点序列分型（MLST） MLST是一种重要的分子分型技术，常用于研究病原微生物的种群动态、传播规律，监测全球性的高危克隆。截至目...
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大肠埃希菌的分型和克隆传播第一部分：大肠埃希菌的流行病学分型 1.1 系统发育分型（Phylogroup） 大肠埃希菌（Escherichia coli）通常使用phylogroup（称为亚特异性群体...
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噬菌体的分类与命名：从传统形态到基因组学第一部分：病毒分类与命名的通用规则 1、病毒分类的负责机构 病毒的分类和命名一般由国际病毒分类委员会（ICTV）负责，但ICTV不负责种以下的分类如血清型、基因型等，这些需要...
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使用Minimap2软件进行全长转录组测序数据比对Minimap2的安装 方法一：conda安装 # 创建并进入conda环境 conda create -n Minimap2 -y source activate Mini...
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【文献速递】中国鲍曼不动杆菌血流分离株的基因组流行病学与系统动力学文章题目：Genomic epidemiology and phylodynamics of Acinetobacter baumanniibloodstream isola...
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【文献速递】基于微生物社会性行为构建植物促生型合成菌群文章题目：Bacterial socialinteractions in syntheticBacillusconsortia enhance plant growth 文章...
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一分钟了解Linux神器：cat命令
今天我们来聊聊Linux世界里一个看似简单，却无处不在、超级实用的命令——cat。 什么是cat？ “cat”其实是concatenate 连接）的缩写。不过别担心，它的功能...
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中华临床感染病杂志 | 噬菌体治疗临床应用管理专家共识（2024版）噬菌体治疗临床应用管理专家共识（2024版）由中国噬菌体研究联盟、中国生物工程学会噬菌体技术专业委员会及中国微生物学会医学微生物学与免疫学专业委员会共同制定，旨在规范噬菌体治...
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Linux命令重定向详解
在Linux系统中，重定向是命令行操作中一项强大且常用的功能，它允许用户灵活地控制命令的输入和输出流。通过重定向，命令的输出可以保存到文件中，错误信息可以单独处理，或者从文件...
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Pigz：高效的并行压缩工具
随着基因组学与组学研究的快速发展，研究人员面临着海量数据的处理和存储挑战。高通量测序技术（如二代测序、三代测序等）所产生的数据量巨大，常常达到数百GB甚至TB级别，如何高效、...
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Grep：探索命令行的强大工具
在日常的编程和系统管理工作中，我们常常需要处理大量的文本数据，如何高效地从中筛选出有用的信息呢？今天，我要介绍一个非常强大、又简单易用的命令行工具——Grep。 什么是Gre...
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【文献速递】碳青霉烯酶高毒力肺炎克雷伯菌的IncFIIK34 KPC-2质粒全球性研究文章题目：Global emergence of Carbapenem-resistant Hypervirulent Klebsiellapneumoniae driven...