发简信
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cellphonedb v5注意事项
安装时出现报错： 原因： MACS2 2.2.7.1的requirement写错了解决;去/usr/local/python3/lib/pyth...
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Scanpy中sc.tl.rank_genes_groups得到LFC为Nan错误情况：出现Nan 根据https://github.com/scverse/scanpy/issues/653[https://github...
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毕业论文注意事项
如何让tab首行缩进为2个字符：https://zhidao.baidu.com/question/210792022.html[https:/...
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序列保守性分析及Seqlogo展示
步骤一：多序列比对 CSV与Fasta文件格式相互转化[https://cdcgov.github.io/CSV2FASTA/] 序列比对在线网...
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在scanpy中选择细胞
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bbknn仅对umap有效
今天试了一下在jupyter看pseudotime 在用Palantir和Cellrank的时候都出现了一个问题，就是批次效应非常明显，明明已经...
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Adobe illustrator科研组图学习笔记（针对Mac）
绘图要求（以Cell为例） 画板一般选择“letter” 字体使用Helvetica或Arial。 分辨率：彩图≥300 dpi，黑白图≥500...
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利用matplotlib保存图片ref[https://blog.csdn.net/baidu_41798699/article/details/120267005] 一定要保...
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批量读取cellranger以构建adata
首先构建一个dataframe，包含相关的metadata 读取内容包括转录组、TCR和Loom文件，注意看看TCR和转录组的barcode是否...