发简信
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序列保守性分析及Seqlogo展示
步骤一：多序列比对 CSV与Fasta文件格式相互转化[https://cdcgov.github.io/CSV2FASTA/] 序列比对在线网...
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在scanpy中选择细胞
https://scselpy.readthedocs.io/en/latest/Tutorial.html[https://scselpy.r...
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bbknn仅对umap有效
今天试了一下在jupyter看pseudotime 在用Palantir和Cellrank的时候都出现了一个问题，就是批次效应非常明显，明明已经...
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Adobe illustrator科研组图学习笔记（针对Mac）
绘图要求（以Cell为例） 画板一般选择“letter” 字体使用Helvetica或Arial。 分辨率：彩图≥300 dpi，黑白图≥500...
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利用matplotlib保存图片ref[https://blog.csdn.net/baidu_41798699/article/details/120267005] 一定要保...
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批量读取cellranger以构建adata
首先构建一个dataframe，包含相关的metadata 读取内容包括转录组、TCR和Loom文件，注意看看TCR和转录组的barcode是否...
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批量处理cellranger
为了便于处理，选择用循环cellranger count和cellranger vdj来分别处理转录组和TCR文件，而非用cellranger ...
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Md5批量检测
参考这个[https://blog.csdn.net/imliuqun123/article/details/88838785] 最重要的是要把...
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anndata获得表达矩阵
直接adata.to_df()就可以了，不用那么麻烦