刷微信公众号时，翻到《火山图|给你geneList, 帮我标注到火山图上》的推文，刚好最近在做火山图，下面就来一起学习。如有疑问请翻阅原文，在最下面参考链接。 核心点：将不需...
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【R>>volcan】任意genelist，标注到火山图 -
GSEA软件的二次作图我们知道，用GSEA的java软件分析的结果之后，默认的图是png，而且只有72 dpi，比如下面这样的 其实颜值也还好，但是很模糊，这是很不方便用于发文章的，那么有没有一些...
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使用log2FC排序的基因集进行GSEA分析目前做GSEA主要有两种办法，一种是使用GSEA的java软件，另一种是使用R语言包，当时还有在线的工具做GSEA的数据也有两种，一种是有基因表达矩阵和分组，另一种是使用两列...
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首次揭示 SLC22A12 可能是抑制 ccRCC 进展的诊断和预后生物标志物Low Expression Levels of SLC22A12 Indicates a Poor Prognosis and Progresses Clear Cell ...
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Seurat对象数据结构1、标准流程里面的过滤三步骤，也可以用 SCTransform 代替 Seurat基本教程[Seurat%E5%9F%BA%E6%9C%AC%E6%95%99%E7%A8%8...
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RNA-seq入门实战（一）：上游数据下载、格式转化和质控清洗本节概览：1.在文章中找到 GEO accession number, 从NCBI获取数据SRR号2.在linux中使用prefetch命令根据SRR号下载SRA文件3.使用...
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R语言~高级PCA分析主成分分析，不只需要找到几个虚拟但不知具体为何物的主成分因子，还需要知道我们提供的变量在各个主成分因子上的载荷（有正有负）和贡献度，以及具体保留多少个主成分因子才能既尽量保留...
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跟着Genes|Genomes|Genetics学数据分析：R语言edgeR包做转录组差异表达分析论文 Sex-Specific Co-expression Networks and Sex-Biased Gene Expression in the Salmonid B...
