你好，我想问一下从bam文件出发怎么得到purbayes的输入文件？
MCMC-PurBayesRelated Knowledge 异质性 肿瘤的异质性是恶性肿瘤的特征之一，是指肿瘤在生长过程中，经过多次分裂增殖，其子细胞呈现出分子生物学或基因方面的改变，从而使肿瘤的生...
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@王诗翔 运行过程中出现这个问题怎么解决呢？
[1] "Capping 0 segs at tCR = 5.0"
[1] "Expected copy-ratio = 0.69119"
[1] "Mode flag is NA, not generating plots. Sample has failed ABSOLUTE"
[1] TRUE解析ABSOLUTE软件
简介ABSOLUTE ABSOLUTE是Broad研究所开发的一款癌症CNV分析软件，实质是一个R包，可以定量细胞的绝对拷贝数、肿瘤纯度与倍性，如果提供突变数据，还能探究克隆...
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@王诗翔 就是说预测的肿瘤纯度在那儿看，，没事，已经了解了，但是我的两个输入文件明明和示例文件格式相同，为什么在run.absCNSeq（）的时候会报这样的错误：
> my.res.list <- run.absCNSeq(example_cn, example_snv, "myResult", "Sample1", seq.type="WES", min.seg.len=200)
Error in data.frame(x = qs, y = r, wt = wts.cn, lqs = 2, ix = 1) :
arguments imply differing number of rows: 0, 1使用absCNseq
安装与导入 使用 测试SNP数据 安装与导入 导入： 使用 absCNseq包没有提供手册，不过提供了一些样例数据，下面看下使用的方法和测试的效果。 主函数为run.absC...
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@王诗翔 这个方法不是可以检测肿瘤纯度吗？相关的输出文件在哪儿，跑了示例文件没找到啊
使用absCNseq
安装与导入 使用 测试SNP数据 安装与导入 导入： 使用 absCNseq包没有提供手册，不过提供了一些样例数据，下面看下使用的方法和测试的效果。 主函数为run.absC...
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@王诗翔 真心感谢，使用abscnseq是不是也是同样的流程，但是它除了拷贝数结果文件，SNV结果文件也是必需的是吗？
解析ABSOLUTE软件
简介ABSOLUTE ABSOLUTE是Broad研究所开发的一款癌症CNV分析软件，实质是一个R包，可以定量细胞的绝对拷贝数、肿瘤纯度与倍性，如果提供突变数据，还能探究克隆...
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想问一下从bam文件出发怎么运行，之前您写的那个使用AbsCNseq输入文件格式好像和ABSOLUTE是一样的，真心求助啊！
解析ABSOLUTE软件
简介ABSOLUTE ABSOLUTE是Broad研究所开发的一款癌症CNV分析软件，实质是一个R包，可以定量细胞的绝对拷贝数、肿瘤纯度与倍性，如果提供突变数据，还能探究克隆...
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你好，我的R版本为3.4，安装失败了，请问这个方法是对R版本有要求吗？
使用absCNseq
安装与导入 使用 测试SNP数据 安装与导入 导入： 使用 absCNseq包没有提供手册，不过提供了一些样例数据，下面看下使用的方法和测试的效果。 主函数为run.absC...
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