生物信息学分析和作图是科研狗们的必备技能。近几年，随着数据类型的增多，excel、SPSS等常用软件已经不能满足科研需求了。R语言以其方便、快捷的优势，迅速获得许多编程技术不...
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常用生物信息学分析在线网址 -
解决pRRophetic R包报错：Error in if (class(testExprData) != "matrix") stop("ERROR: "testExprData" must ...今天用pRRophetic R包时发现不能用了，出现Error in if (class(testExprData) != "matrix") stop("ERROR: \"...
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GSA、GSEA、ssGSEA、GSVA的算法原理及它们的联系与区别一、 简述 为了从基因的表达水平中得到更加具体直观的生物学功能变化的信息，多种基于已知的基因集的分析方法应运而生。其中，基因集分析（Gene Set Analysis...
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RNA三维结构预测与比较Pymol使用[https://www.jianshu.com/p/a585f1173a32]Zhang lab[https://zhanggroup.org/] 二级结构预...
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TCGA转录组差异分析后多种基因功能富集分析：从GO/KEGG到GSEA和GSVA/ssGSEA（含基因ID转换）测序上游分析系列： mRNA-seq转录组二代测序从raw reads到表达矩阵：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量测序pipeline：从raw r...
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生物信息学入门博客推荐（不定期更新）
0642021 更新 1、生信宝典[http://blog.genesino.com/] 整理比较系统，推荐。 2、生信菜鸟团[http://www.bio-info-tra...
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RNA-seq 分析 normalization方法之TMM
背景 在使用过程中存在一些疑问，所以就认真一探究竟。Normalization 的方法很多，适应的条件也不一样。下面两篇讲的比较清晰建议下看下。参考：https://www....
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TCGA数据差异分析后生存分析（批量单因素cox回归/Lasso筛选，多因素cox建模，时间依赖ROC曲线及KM plot可视化）测序上游分析系列： mRNA-seq转录组二代测序从raw reads到表达矩阵：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量测序pipeline：从raw r...
