基本概念 SNP:单核苷酸多态性主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。 SNP位点注释:顾名思义也就是把SNP位点信息和基因组信息相关联,比如有多...
参考文献:Transcript-level expression analysis of RNA-seq experiments with HISAT, StringTie ...
写在前面 本文主要参考生信小白2018[https://www.jianshu.com/p/bb4281e6604e]与多啦A梦的时光机[https://www.jiansh...
1hisat2 1.1介绍 • 总体上来说HISAT利用了BWA和Bowtie的算法,同时解决了mRNA中不存在内含子难以比对的问题,比对上代主流RNA-seq比对工具能快5...
向日葵是吃瓜群众喜闻乐见的一种植物,除了能够长出朵朵葵花向太阳的萌萌大脑袋,还能结出令人爱不释手的瓜子,无论干炒、奶油、五香,都很好吃!不仅如此,向日葵还是重要的油料作物,葵...
转自:https://www.jianshu.com/p/9d28de3d18e6[https://www.jianshu.com/p/9d28de3d18e6] 一、4Dt...
2021-3-18 update: 一个新的铁皮石斛基因组发表在《药学学报》英文版上,该期刊最新的影响因子为7.0972020-11-18 update: 黄芩和半枝莲基因组...
前两年能投的现在都投不了了,现在投哪些合适呀?
【基因组】那些接收植物基因组de novo组装文章的期刊(2021-3-18更新)2021-3-18 update: 一个新的铁皮石斛基因组发表在《药学学报》英文版上,该期刊最新的影响因子为7.0972020-11-18 update: 黄芩和半枝莲基因组...
多翻翻结果,文件里有扩张收缩基因,提取完之后再去用R做GO分析(这个网上有教程)
基因家族扩张与收缩分析及物种进化树构建(上)一、数据准备 首先,选取不同物种的Protein数据集:Arabidopsis_thaliana.fa;Citrus_grandis.fa;Dimocarpus_longan...
从广州到云南旅游攻略,不用3000~ 大家好,我是鲁七爷。 今天给大家分享一下去云南旅游的攻略,全程算下来,我都没用3000,但是玩得好爽。 现在感觉大理的海,大理的天,大理...
一、4Dtv(四倍简并位点颠换率)的定义 4DTV stands for four-fold synonymous (degenerative) third-codon tr...
mafft可以用来进行快速的序列比对,因为其可以设置多线程。具体的命令行如下: 接下来等着运算完就可以使用iqtree来建树了,具体命令行如下: -b指代的是bootstra...
一、多物种某基因家族的氨基酸序列fasta文件的准备(此例为yth基因家族) 1.已鉴定物种的某基因家族文件的获取 HMM文件准备 查找pfam号如何查找基因家族pfam号:...