Smart is the new Sexy
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昆虫学博士，分享实验Protocol、生物信息、科研绘图、中国传统术数学等。
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跑通GWAS，用这些脚本就够了最近跑通了一遍GWAS分析，全程在linux操作，虽然具体还有好多需要微调的地方，先把代码整理分享出来mark一下 前期准备 1.理论知识 强烈推荐百迈客云课堂课程GWAS生...
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免疫学硕士一枚～<br>生信热爱者但是小白一枚~<br>目前成就为0~<br>加油哦，一大波成就正在路上啦~<br>啾~猪莎要加油哦~
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SRA 数据下载自救指南还在羡慕海峡那边的朋友下载SRA 快到飞起？还在难过用wget 下载数据经常下载不完整？用了官方的下载工具还是慢的不行？这里有一个SRA 下载自救尝试指南供你参考。 需要用到...
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简书不再更新，个人主页 <a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fkaopubear.top" target="_blank">https://kaopubear.top</a> 邮箱联系 hi@kaopubear.top
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ChIP-seq详细分析流程参考生信技能树1以及生信技能树2只记录从数据下载，到最终结果展示，具体生物学知识请自行查阅稍后关于ChIP-seq的背景知识我会再发布一篇文章。数据下载：数据存放地址关于环境...
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测序数据质控和预处理之fastp
1. 引言 下机的FASTQ数据通常需要进行质控和预处理，以保证下游分析输的准确性。fastp软件仅扫描数据文件一次，就可以完成FASTQC + cutadapt + T...
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GWAS 总体流程理解版
自己找了一些文章和视频，先总结了一部分，后面再做补充和实操 一. 相关概念理解 （1）GWAS： 全称“全基因组关联分析”，使用统计模型找到与性状关联的位点，用于分子标记选择...
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公众号：TOP生物信息<br>B站：TOP菌<br>WeChat：TOPJUN996<br><br>top2读研，学习方向：癌症基因组、肿瘤免疫、单细胞组学
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使用trim_galore对数据进行质量控制-过滤写在前面参考1[https://cloud.tencent.com/developer/article/1625193]参考2[https://www.jianshu.com...
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FastQC数据质控报告的详细解读
Basic Statistics 基本信息 Encoding: 测序平台编号，现在Sanger/ Illumina 1.8以上都是Phred 33编码 Total sequ...
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FastQC质控报告解读一般FastQC分析结果产生有2种类型的文件，一种.zip，一种.html。直接点击.html文件，即可在浏览器中查看质控结果报告。 Summary 首先是Summary，这...
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GEO上都是芯片数据吗？GSE开头的都是芯片吗看过很多GEO数据挖掘的教程，一直都是芯片数据举例。我自己也根据流程（Taolu）分析过好几个geo芯片数据。一直有个疑惑， GEO上都是芯片数据吗？ GSE开头的都是芯片数...
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miRNA-seq分析流程参考0[https://cloud.tencent.com/developer/article/1054975]参考1[https://www.jianshu.com/p/8...
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RNA-seq练习 第一部分（原始数据下载，提取fastq文件，fastqc质控）原始数据来源于这篇文章https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE50177 1.下载原始数据https://...
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中科新生命前身为中国科学院上海生命科学研究院蛋白质组研究分析中心（RCPA）
