上文下载好gdc_download....tar.gz的压缩包和metadata文件后，将压缩包解压到一个文件夹，metadata文件放入另一个文件夹。可以看到LIHC_gd...
IP属地：广东
-
2.R合并下载的TCGA数据
-
2021-05-23 ChIP-seq数据从头到尾比对及分析汇总（个人分析记录贴）0_1 前言 有时间再详细写introduction。先把我分析数据的流程记录下来，后续持续更新。 0_2 用到的软件或脚本 测序数据质控：fastp[https://git...
-
Error in UseMethod("explain") : no applicable method for 'explain' applied to an object of cla...
昨天运行随机森林代码时突然报错： 必应搜索报错语句 👇看到github上的回答：https://github.com/thomasp85/lime/issues/48[htt...
-
肿瘤相关巨噬细胞的标志物
考虑到巨噬细胞亦正亦邪，在各种生物环境中发挥复杂的作用，研究人员一直在探索它们的丰度和功能。这份指南概括了巨噬细胞表达的基因，以及适用于检测的免疫学工具。 巨噬细胞（Macr...
-
单细胞测序——髓系细胞注释marker主要根据文献中的描述与方法 髓系细胞分类 巨噬细胞，单核细胞，DC细胞 文献一：Single-cell landscape of the ecosystem in early...
-
生信小白教程之Count转TPM，FPKM相信很多科研工作者（不包括比我厉害的大佬们）在做转录组时，都是在公司做测序，然后数据也交给公司分析，又然后，期待做个差异分析，得出像下图那么完美的热图。 然而，然而，，我们得...
-
-
SCENIC单细胞转录因子分析1. 简介 SCENIC（single-cell regulatory network inference and clustering）是一个基于共表达和motif分析，计...
