OrthoFinder 鉴定直系同源基因，构建物种树的神器，今天在服务器安装了一次，踩了好多个坑，终于安装上了。 安装方法 conda: conda install -c b...
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【软件填坑日记】服务器安装OrthoFinder
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如何寻找同源基因---OrthoFinder
构建物种的系统发育树，计算kaks值或者比较基因组学和进化的其他分析都少不了需要寻找同源基因。之前已经介绍过Orthomcl的自动化使用，Orthomcl也是目前引用最好的寻...
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Biopython学习笔记（四）访问NCBI Entrez数据库Entrez是一个检索系统，供人们访问NCBI里各个数据库。比如说：PubMed, GenBank, GEO等等。你可以通过网站来搜索你想要的内容：https://www.n...
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Biopython学习笔记（三）Blast使用BLAST通常可以分成2个步。这两步都可以用上Biopython。第一步，提交你的查询 序列，运行BLAST，并得到输出数据。第二步，用Python解析BLAST的输出，...
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充电课-顺式作用元件分析（基础知识及预测）
概念： 顺式作用元件(cis-acting element)是存在于基因旁侧序列中，能影响基因表达的一段DNA序列，它们的作用是参与基因表达的调控；顺式作用元件本身不编码任何...
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