单细胞测序方法和原理系列： 1. 单细胞转录组建库原理：SMART、TargetAmp和10X genomics[https://www.jianshu.com/p/6c5d...
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单细胞免疫组库：TCR基因重排原理和TCR测序建库方法 -
抗生素治疗中耐药性resistance，耐受性tolerance和持久性persistence(?)的区别
3背景 抗生素的耐受性与抗生素治疗失败以及许多细菌感染的复发相关。并且与耐药性不同，它需要使用MIC法进行测量，由于一种相似定量分析指标的缺乏，耐受性成为一种特征比较模糊的指...
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肿瘤突变分析神器-maftools包得益于曾老师的介绍引导，了解此包。了解一个包，先看包的说明书，包的用法都在里面。maftools包说明书 1.安装包，加载包 source("http://bioconduc...
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TCGA数据库MAF文件的分析以及可视化（maftools包的使用）这两天“王院长”帮别人分析snv数据，顺便给我推荐了一个R包：maftools。我看了一下官网，感觉是个非常强大的R包。那必须要学习起来~实际上网上已经有很多教程了，但都是用...
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custom_channels，default_channels和channels有什么不同？
custom_channels、default_channels和channels都是.condarc文件中用于配置软件包源的选项，但它们之间有一些不同。 custom_ch...
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5 分钟入门 Google 最强NLP模型：BERTBERT (Bidirectional Encoder Representations from Transformers) 10月11日，Google AI Languag...
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荐书丨基因蓝图：DNA如何塑造性格、智力和行为？-【享书社】
基因蓝图：DNA究竟如何塑造我们的性格、智力和行为？ 掌握基因蓝图，认识真实自我！科学大咖45年研究巨献，行为遗传学重磅著作，缓解育儿焦虑的科学良药，给所有人的遗传学和心...
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社交指纹：通过DNA-启发的行为建模的组机器人检测（Social Fingerprinting: Detection of Spambot Groups Through DNA-Inspired...摘要 本文展示了一个高效机器人检测系统，通过分析账号的行为并使用数字DNA技术来建模社交网络用户的行为。是收到生物学的启发，数字DNA能够用一系列编码的字符能够表示账号的行为...
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基因和染色体_基因是DNA_超螺旋影响DNA结构-YHM-20191024
超螺旋结构&张力 -DNA的两条链相互缠绕形成双螺旋结构；双螺旋结构也可以自身相互缠绕，来改变DNA分子的空间构象或拓扑结构(topology)，这就是超螺旋(superco...
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【块】GWAS-1 概念
Genome-wide association study(GWAS)： 简单的说，使用统计模型找到与性状具有协同性的位点，性状指的就是Common complex huma...
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GWAS分析总体流程
概念 （1）GWAS： 全称“全基因组关联分析”，使用统计模型找到与性状关联的位点，用于分子标记选择（MAS）或者基因定位 （2）GWAS分析的两类性状： 分类性状（阈值性状...
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孟德尔随机化发高分SCI必备的一些基本概念及计算-MAF
大家好，孟德尔随机化很多人都是从TwoSampleMR包入手学习的，很多GWAS的概念如果不搞清楚，写SCI的时候容易犯一些概念性的错误，低分的杂志可能大家都很水，可能也就一...
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EnhancedVolcano -- 火山图全攻略小郭叨叨叨：本文档主要介绍EnhancedVolcano包及参数说明。作者 Kevin Blighe，R包信息参见Publication-ready volcano plot...
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R语言绘图包03--火山图EnhancedVolcanoR语言绘图包系列： R语言绘图包01--优秀的拼图包patchwork[https://www.jianshu.com/p/e57555d48c91] R语言绘图包02--热...
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【R语言】解决GO富集分析绘图，标签重叠问题前面小编给大家详细介绍过 ☞GO简介及GO富集结果解读[https://link.zhihu.com/?target=http%3A//mp.weixin.qq.com/s%...
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一文掌握R包DESeq2的差异基因分析过程转录组测序的最直接目的，就是设法寻找组间显著表达变化的基因，解释基因表达水平的变化对生物功能的影响。例如，肿瘤患者与正常人群相比哪些编码蛋白或非编码RNA分子发生了失调，这些...
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R语言中字符串的处理(2/3)-分割、提取、替换
本文转自微信公众号: 一遇之见 的 大作 R中字符串处理：函数实现[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI3NzY0MzkzOQ==&mid...
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RNA-seq入门实战（五）：差异分析——DESeq2 edgeR limma的使用与比较本节概览：1.DESeq2、 edgeR、limma的使用2.三类差异分析软件的结果比较——相关性、韦恩图3.选取差异基因绘制火山图和热图 承接前期文章：RNA-seq入门实...
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生信基础：ID转换、参考基因组注释（R）
（一）ID 转换 参考：https://blog.csdn.net/weixin_40739969/article/details/89354167 方法一 方法二 方法三 ...
