发简信
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张泽民老师系列文章解读(三)说在前面 我们在前两期推文：张泽民老师系列文章解读(一)[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI4MjY5ODI1Nw==&mid=2247...
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基于Seurat UAMP和celltype的RNA Velocity速率分析的全套流程参考资料：参考生物技能树[https://mp.weixin.qq.com/s/TJsdj7qesZGlvmEkNLAy0A]Velocyto官网Tutorial[https...
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Seurat v3版本安装
1.默认安装v4版本 2.因为有个去批次的R包（iSMNN）需要安装V3版本的Seurat，所以我需要安装Seurat v3版本但是在此过程中一直在报错： 发现只有spats...
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基因家族分析保姆级教程（分子进化）-生信小白自学之路（一）一、基因家族基础知识与研究思路介绍 1.基因家族简介 基因是染色体上一段可以发生转录的区域（内含子外显子启动子）。转录本才是基因的研究实体，转录本transcript（别名 ...
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python pyensembl:基因组位置注释到基因组特征（基因，转录本，外显子）
PyEnsembl 为用户访问 Ensembl[http://www.ensembl.org/]参考基因组数据提供了一个很好的接口。可以直接从Ensembl FTP服务器下载...
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ATAC-Seq入门加高阶传送门还记得生信技能树的传送门系列吗？转录组、甲基化、ChIP-Seq、lncRNA、编程实战、还有已经在更新中的Hi-C......几乎大家关心的数据分析都可以在大树里找到入门和...
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ChIP-seq数据分析（一）：从raw reads到peaks开篇致谢：下面内容的整个框架是跟着生信技能树发布在bilibili上的ChIP-seq视频学习的，链接：https://www.bilibili.com/video/av29...
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高通量测序数据处理学习记录（四）：DeepTools学习笔记前言 开题啦，所以需要整合自己之前处理过的数据包括可视化作图，在GALAXY上翻到DeepTools正好有着一点用处，适当的搞了一波事情，顺带记录一下。GALAXY上可以可视...
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2020年转录组文章到底有多难发？一文说明白！转录组是一类让人既爱又恨的项目，实验门槛低，却是文章泛滥的重灾区，总有人问小编，现在转录组还能发文章吗？下面小编就借一篇2020年5月4日发表在BMC Genomics上题为...
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NGS 数据过滤之 Trimmomatic 详细说明
tags： Trimmomatic NGS fastq NGS 原始数据过滤对后续分析至关重要，去除一些无用的序列也可以提高后续分析的准确率和效率。Trimmomatic 是...
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第7篇：用Y叔的ChIPseeker对peaks进行注释和可视化上一步骤（第6篇：重复样本的处理——IDR）用IDR对重复样本peaks的一致性进行了评估，同时得到了merge后的一致性的peaks——sample-idr，接下来就是对p...
