变异数据处理的总体思路如下: 1.数据下载 TCGA的突变数据有4个软件得到的不同版本: 这个可以在gdc的官网上找到,case选择KIRC,文件类型选择maf即可获得。 选...

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变异数据处理的总体思路如下: 1.数据下载 TCGA的突变数据有4个软件得到的不同版本: 这个可以在gdc的官网上找到,case选择KIRC,文件类型选择maf即可获得。 选...
转录组分析 上一节,我们简单介绍了 CNV 数据的处理以及突变数据可视化。下面我们简单介绍一下转录组数据分析中必不可少的差异基因分析,以及通路富集分析 1. 数据准备 我们来...
在高通量测序数据的分析中,仅仅靠raw read counts描述基因的表达量是远远不够的。受限于测序过程中的技术因素影响,read counts对于基因表达量的反映存在一定...