问题描述：遇到一位同学他的SEQ数据是13年的，illumina双端测序，而且是无参物种，分别是病毒和昆虫拼接好的转录组序列。而且还不是同一批样本。然而我比较熟悉RNAseq...
IP属地：福建
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2021-03-04 blast+ 比对两个denovo RNAseq序列
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R语言计算FDR/p-value
data <- read.table("./FPKM.txt",sep = '\t',header = T) p1 <-as.matrix(p_value) p2 <-as....
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conda下载及安装以前做生物信息都需要去各种各样的生物软件官网进行软件下载，不过现在有一个conda就够了。它就像是我们windows系统里的360软件中心，大部分软件都可以通过它来进行下载和...
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TCGA突变数据下载与处理实验内容 1.在TCGA数据库下载疾病BRCA的突变数据熟悉TCGA数据库的结构与数据下载方法2.处理下载数据，将其变为列为样本行为基因的形式并输出（数据处理过程中去掉同义突...
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2万个基因cox回归分析Cox比例风险模型（考克斯，1972年）是常用的统计在医学研究调查的患者和一个或多个预测变量的存活时间之间的关联回归模型。基础知识可见：R-回归分析[https://mp.w...
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ggplot2超详细讲解一.基本概念 "一张统计图形就是从数据到几何对象(geometric object, 缩写为geom, 包括点、线、条形等)的图形属性(aesthetic attribute...
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GEO数据表达差异分析1-1从GEO数据库下载数据 1-2提取表达矩阵exp 1-3提取各样本的分组信息 1-4调整exp的行名顺序与pd列名完全一致 1-5提取芯片平台编号，保存 2-1提取分组...
