六六_ryx

上一篇介绍了使用ChIPseeker对peaks的分布和邻近基因的注释。除此之外，下游分析通常还包括鉴定我们感兴趣的蛋白质结合的motif；鉴定这些结合区域的基因以及这些基因...

xuzhougeng

对于集合的可视化，第一时间想到的都是韦恩图（venn diagram），一般集合不超过5个的时候，可视化效果还是不错的 但是一旦数据集增加，比如说五个的时候，你就很难从图中解...

jlyq617

之前我们用热图的形式展现了相关关系，今天我们来用另外几种形式来展现相关关系的图。本文代码来源：Visualize correlation matrix using corre...

生信石头

简单记录一下，一般我是如何快速了解一个课题方向？此处还是以“基因家族”为例。 首先，直接上 CNKI 官方网站，检索基因家族名字，按「被引次数」排序，选择相对权威的期刊，如...

geneonto

启动子 启动子是RNA 聚合酶识别、结合和开始转录的一段DNA 序列，它含有RNA 聚合酶特异性结合和转录起始所需的保守序列，多数位于结构基因转录起始点的上游,启动子本身不被...

Bioinfor生信云

OrthoVenn2 OrthoVenn2是一个网页版的基因家族聚类工具，它基于OrthoMCL。选择要分析的物种，也可上传蛋白序列 分析结果 OrthoFinder 将多个...

生信石头

写在前面 不少人应该知道，在生物模式，通路，调控机制上，PPT 已然是常规工具之一。类似的，那么画卡通热图，PPT一样靠谱。我们知道，Adobe Illustrator 和 ...

生信石头

写在前面 很多时候，我们会看到一些文稿，上来就是“我研究的物种如何如何重要”。其中，最有说服力的，或许就是，基于“FAO STAT”，品类产量几何几何。以前，我也不多关注这个...

生信石头

写在前面 为什么 TBtools 用起来舒服，相比于不少其他软件，同质非同质的？我想了很久，可能原因之一，即“开发者即用户本身”，简单来说，“我写的软件是就是给自己用的”，而...