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测序深度和测序覆盖度，怎么估算？在我们开始测序之前，经常会被问道，你需要的测序深度和测序覆盖度的概念，比如在测序线粒体的DNA时候，测序小哥就问说1个G的数据量够了吗？下面就给大家解释下这两个概念： 测...
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单细胞转录组数据的跨物种分析文章信息 作者信息 摘要： 使用scRNA测序分析成千上万个单细胞的能力彻底改变了细胞和发育生物学领域，为跨许多物种的细胞类型和功能的多样性提供了令人难以置信的见解。这些技术...
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单细胞轨迹分析之应用篇作者，Evil Genius 最近见到了很多研究者，真的是不把单细胞轨迹分析当回事，拿到样本不定义直接跑monocle，这能对么？我看了都着急，基本理论要多多学习啊~~~，网...
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超全总结--单细胞+空间转录组的整合分析方法总结这一篇我们做一个详细的总结，周五了，疫情还没结束，父母也都老了，有时候真的感觉身为儿子实在不孝，常年在外，回家很少，家里有点事父母也不会跟我这个儿子说，小病小灾的也舍不得去医...
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10X空间转录组的注释流派作者，追风少年i~ 高考第二天，去看了一下在今天高考的数学卷子，惊奇的发现最后的压轴题自己还会做，😄 ，大家不妨试一试，题在下面 以前学数学的时候总是觉得生活中根本用不到，买...
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10X单细胞（10X空间转录组）原始数据真的是zero-inflated分布？今天我们来将一个数据分布的情况，接触10X单细胞或者10X空间转录组不久之后，就认识到了一些数据的特征，比如经常提到的dropout/missing data/zero-in...
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NGS原理- 单细胞转录组测序-介绍CEL-seq2, Drop-seq, SCRBseq, Smart-seq
转载自https://www.plob.org/article/9429.html 导读 在单细胞研究的大潮中，新的测序方法层出不穷。不过，很少有人对这些方法进行系统的比对。...
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DSP(Digital Spatial Profiler)空间转录组与单细胞数据联合分析之cell2location这一篇继续回顾一下cell2location，使用我们推荐用于基于探针的空间转录组学数据的 cell2location 方法的一个版本，将胎儿脑细胞类型映射到使用 Nanos...
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10X单细胞空间联合分析之cell2location的详细梳理又是周五，马上元旦，不知道大家打算怎么跨年呢？但是，今天还是工作日，我们还是要学习学习，不负韶华。 这一篇还是想详细梳理一下cell2location，包括算法以及代码的写法...
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10X单细胞空间个性化回顾总结这一篇，我们继续总结，这里用到的PPT是我给产品技术培训用的PPT，当然了，有一些内容一笔带过，有的地方详细讲了讲，免费分享给大家，祝愿大家科研顺利，喜欢生物信息的，喜欢单细...
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10X单细胞空间转录组联合分析之DAVAE隔离的第10天，孤独仍在，且行且珍惜，每个人都会做一些选择，选择之后，珍惜眼前人。好了，今天我们分享的方法是10X单细胞、10XATAC、10X空间转录组联合分析相互之间的联...
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人类肝脏的单细胞、单核和空间 RNA 测序可识别胆管细胞和间充质异质性hello，周二了，隔离的第二天，一个人的日子总是难熬，耐得住寂寞的人，都成了圣人~~~，今天我们分享的文献在Single-Cell, Single-Nucleus, and...
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10X单细胞空间数据分析之表征细胞状态和生态型（EcoTyper）隔离的第三天，一个人的日子总是很难熬，没办法，孤独总是常伴我身，今天我们分享的文献在Atlas of clinically distinct cell states and ...
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Nature Reviews Genetics| 在基因组学中应用机器学习的常见陷阱Nature Reviews Genetics| 在基因组学中应用机器学习的常见陷阱 Whalen, S., Schreiber, J., Noble, W.S. et al...
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R语言入门--第九节（功效分析）功效分析是在实验设计筹备阶段进行的分析手段。一般用于求达到目标显著性水平与功效（把握），求所需样本量；或者给定样本量，实验有多大的把握做出判断。 0、基础四要素 样本大小：每...
