这是ggplot2可视化专题的第二个实例操作 【ggplot2的基本思路见前文总论】：基于ggplot2的RNA-seq转录组可视化：总述和分文目录 【ggplot2绘图具体...
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单/多个基因在组间同时展示的多种选择：分组小提琴图、分组/分面柱状图、单基因蜂群点图拼图绘制 -
2、RNAseq(2)--测序原始数据处理（Clean data）1、fastq文件 一般我们从公司里得到的原始测序数据都是属于fastq.gz文件, .gz是一种压缩格式的缩写，于是首先第一步是对这些压缩格式进行解压操作 解压好的文件即正...
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GO和KEGG富集分析（非模式生物GO和KEGG注释）
GO和KEGG富集分析是生物信息分析中常用的一种分析，针对不同的物种，大概整理了一下，我将其分成四类。 1. 人和小鼠等模式生物 最常用的就是clusterprofiler，...
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2020-12-17水稻、小麦GO富集分析RNAseq常规做法是先筛选出差异表达基因，然后针对筛选出来的差异基因做GO富集分析。 1.水稻、小麦GO信息提取 在进行GO富集分析前首先要确定在你所使用的GO富集分析软件...
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GO富集分析四种风格展示结果—柱形图，气泡图前面给大家简单介绍过☞什么是Gene Ontology(GO)[https://link.zhihu.com/?target=http%3A//mp.weixin.qq.co...
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R语言：gggenes在基因组中画基因箭头图导读 gggenes: Draw Gene Arrow Maps in 'ggplot2'。 Github：gggens[https://github.com/wilkox/...
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【Bioconductor系列】如何用Bioconductor对基因组注释
这一次，我们来聊聊基因组注释。首先问自己一个问题，为什么要进行基因注释。就我目前而言，它用来解决如下问题： 在mapping-by-sequencing的时候，我找到了一些可...
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基因家族分析(3) ggplot2绘制基因结构图本节我们继续来进行基因家族数据可视化的第3节教程，通过ggplot2绘制一个富有美感的基因结构图&蛋白保守结构域图，喜欢的小伙伴欢迎关注，多多支持，原文链接：https://...
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ASV和OTU有什么不同？哪个更好？遇到了一个16S的课题，于是开始认真学习ASV和OTU的差别，顺手整理一下。 扩增子测序和鸟枪法测序已经成为微生物组领域最常见的研究手段。尽管鸟枪法测序可以为我们提供更高分辨...
