EDTA是一个非常好的转座子注释流程，并且它有一个功能是可以根据突变速率推算LTR插入时间。然而，这个软件如果不设置参数--u的话，会使用禾本科的默认插入时间1.3e-8来计...
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根据突变速率进行EDTA结果的LTR插入时间换算
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TEtranscripts--计算转座子(TEs)在RNA-seq中的定量和差异表达
写在前面，最近为了解决这个问题，看了很多软件，要么是单细胞技术，要么是物种限制，总之花了挺多时间。本来打算使用SQuIRE，但是卡在了BUILD_refGene.txt(基因...
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生信分析22：完整的转座子注释流程本次推送是文献分享22的对应内容。我与生信，公众号：我与生信文献分享22：泛基因组解析柑橘亚科进化以及柑橘果实中柠檬酸积累的关键基因[http://mp.weixin.qq....
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入门必看 | 深度解析长末端重复反转录转座子（LTR-RTs）（转发）入门必看 | 深度解析长末端重复反转录转座子（LTR-RTs） 诺禾致源[https://www.jianshu.com/u/ee00dc6faab7]已关注 0.54220...
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根据基因组以及gff3文件提取4dtv位点
现在很多文章都关注4dtv位点，小编接下来分享下根据基因组以及gff3提取所有基因的4dtv位点的perl脚本： 运行程序： 注：该脚本小编不知道来源几何，虽在此分享，若有侵...
