总目录 分子对接1：PyMOL进行可视化[https://www.jianshu.com/p/18b4d56dc516]分子对接2：Autodock Vina进行分子对接[h...
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分子对接2：Autodock Vina进行分子对接 -
分子对接4：Autodock4进行对接并PyMOL可视化总目录 分子对接1：PyMOL进行可视化[https://www.jianshu.com/p/18b4d56dc516]分子对接2：Autodock Vina进行分子对接[h...
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Bray-Curtis距离
Bray-Curtis距离是以该统计指标的提出者J. Roger Bray和John T. Curtis的名字命名的，主要基于OTUs的计数统计，比较两个群落微生物的组成差异...
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扩增子分析——usearch+vsearch+qiime1
参考文章：1.https://www.jianshu.com/p/c72bb359f050[https://www.jianshu.com/p/c72bb359f050]2....
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感谢作者写得很详细，请问有下游分析过程吗😊
扩增子分析——usearch+vsearch+qiime1
参考文章：1.https://www.jianshu.com/p/c72bb359f050[https://www.jianshu.com/p/c72bb359f050]2....
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Qiime1-6.生成OTU表（基于RDP）本节介绍如何生成OTU。生成OTU的方法一共有三类：De novo,Closed-reference,Open-reference。 在开始讲解方法之前先简单说明一下什么是O...
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微生物组16S rRNA数据分析小结：从OTU table到marker物种笔记内容：由二代测序产生的序列数据（.fastq）到OTU table， 距离矩阵，物种多样性指数，序列的进化树及物种注释信息的可分析数据，为常规分析流程。可以使用usear...
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glmnetGlmnet主要用于拟合广义线性模型。筛选可以使loss达到最小的正则化参数lambda。该算法非常快，并且可以使用稀疏矩阵作为输入。主要有线性模型用于回归，logistic...
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华农研究生在读，生信在学，可接1对1保研辅导。
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使用Plink对CNV做GWAS分析（一）
Introduction 随着高通量测序技术的发展，这些年关于CNV（拷贝数变异）的研究也逐渐多了起来。以往CNV主要通过PCR或者CGH芯片等技术进行查找，现在由于二代测序...
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个性化生信分析
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机器学习之分类性能度量指标 : ROC曲线、AUC值、正确率、召回率同见博客：http://zhwhong.cn/2017/04/14/ROC-AUC-Precision-Recall-analysis/(对Latex公式支持更好) 在分类任...
