前言及背景 什么是基因组de novo测序？其是对某一物种进行高通量测序，利用高性能计算平台和生物信息学方法，在不依赖于参考基因组的情况下进行组装，从而绘制该物种的全基因组序...
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一个高杂合真菌基因组组装脚本（改代码版）
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基因组组装----SPAdes(一)
关于基因组组装的流程可以参考我的简书:https://www.jianshu.com/p/e02ecd537c83 前面介绍了SOAPdenovo2的使用，但是由于结果整体不...
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WGCNA构建共表达网络一这次用的数据是几百个小鼠性状的数据。 一：安装 打开Rstudio 二：运行 1.构建共表达网络 2.寻找最佳 β 首先确定sftpowerEstimate = 6。还有ne...
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fastQC对RNA-seq质控
FastQC - A high throughput sequence QC analysis tool fastqc安装 1. 下载fastqc安装包（http://www...
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（1）ATAC-seq和RNA-seq联合分析——原始数据的获取
前言 以这篇文章 Chromatin Accessibility-Based Characterization of the Gene Regulatory Network ...
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FastQC处理二代测序原始数据的质量结果解读当二代测序的原始数据拿到手之后，第一步要做的就是看一看原始reads的质量。常用的工具就是fastqc (http://www.bioinformatics.babraham...
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自己构建物种包OrgDb，然后用clusterProfiler富集分析
利用clusterProfiler进行富集分析时，发现网上没有物种包OrgDb，利用网上教程构建了一个。主要参考了刘小泽的简书，特别感谢一下！！！ emapper首先得到注释...
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2019年第48周：年度总结锲子 去年是2018年第44周：策划时开始着手年度总结的，相比之下，2019年晚了整一个月。最近几日，心里也是颇不宁静，寻寻觅觅的，好像一下子找不到存在的价值了。在今年元旦的...
