之前写的的CHIP-seq和RNA-seq很多练习的数据都是从GEO数据库下载的。但是从来没有细致的了解过GEO这个数据库。趁着还没复工,再多学一点新知识~这次的笔记是生信技...
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之前写的的CHIP-seq和RNA-seq很多练习的数据都是从GEO数据库下载的。但是从来没有细致的了解过GEO这个数据库。趁着还没复工,再多学一点新知识~这次的笔记是生信技...
2018年Cell Systems文章:Dissection of Influenza InfectionInVivoby Single-Cell RNA Sequencin...
我所理解的cellranger软件理想原始输入数据就是SRA格式,然后利用sra-tools分为read、barcode+UMI、index三个fastq.gz文件。最后直接...
简要内容--拟时序分析的定义--结果解读--------做出结果(cluster、state)--------确定起始点--------做start····end的图(并且映...
这是目前为止我看到过的关于ATAC-seq的最新综述,感兴趣的话值得一读。2020.4.22更新:我看到一个公众号也翻译了这篇文章,而且正好跟我这篇翻译是在同一天发表http...
简介 Seurat是一个r包,被设计用于单细胞rna-seq数据的细胞质控和分析。Seurat旨在使用户能够识别和解释单细胞转录组数据中的异质性来源,同时提供整合不同类型...