通过单拷贝基因构建物种树，一般有两种方法： 1，Concatenation（串联法）：将比对完成的单个单拷贝基因依次串联成一个超级基因（super gene/matrix）构...
发简信
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多个单基因进化树整合成一个进化树 -
生信 | 基因组组装实战（四）：组装软件mecat2、flye、wtdbg2、Canu、Falcon写在前面 以下内容均来自我在菲沙基因（Frasergen[http://www.frasergen.com/]）暑期生信培训班上记录的课堂笔记 1.基因组概念 基因组应该指单...
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文献笔记七十二：Chloroplot~叶绿体基因组圈图可视化的新工具文章题目 Chloroplot: An Online Program for the versatile plotting of organelle genomes 期刊 f...
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群体遗传
一、个体对群体遗传组成的影响 生物进化是群体遗传组成随着时间的变化而变化。我们的群体由不同的杂交个体组成，其遗传组成由每个个体携带的基因组组成。由于个体死亡或个体进出人口的迁...
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【名词解释】synteny / collinearity / identity / similarity / homology1. synteny 和 collinearity 用来描述基因组的共线性 synteny 共线性：同源基因在相应染色体上的保留collinearity 同线性：在synte...
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R语言绘图基础篇-PCA加置信圈此文内容首发于微信公众号：R语言搬运工，关注公众号浏览更多精彩内容 **原文链接[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg3NDY2MDcyO...
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什么是SNP(单核苷酸多态性)?
单核苷酸多态性主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。它是人类可遗传的变异中最常见的一种，占所有已知多态性的90%以上。SNP在人类基因组中广泛存在...
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昆虫学博士，分享实验Protocol、生物信息、科研绘图、中国传统术数学等。
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七. 植物叶绿体基因组--组装，注释和比较作图（GetOrganelle，GeSeq，Chloroplot，IRscope）一. 简介 叶绿体是绿色植物，藻类和蓝细菌进行光合作用的场所，光合作用将水和二氧化碳转变为有机化合物并放出氧气。叶绿体所携带遗传物质DNA，以原核细胞的编码方式转录合成一些自...
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R数据分析：主成分分析及可视化
Principal Component Analysis (PCA) is a useful technique for exploratory data analysis,...
