声明:因为本人使用过程中遇到了很多原来人碰得到的问题,放防止以后遗忘,所以做一下记录,因为前总结的很到位,所以直接引用到自己日常记录,供日后查阅。 主要引用为:【原创文章】辣...

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流程是介于脚本与软件的一组代码文件,所以在写流程的时候要知道脚本的基本结构以及软件开发的基本常识。前者要掌握,后者要了解。 出于掌握的需要,重温一下: Name:脚本名字 D...
在NGS分析入门阶段,我们不需要考虑太多的细节,只用知道一个分析的大致流程并完整跑下来即可。太多的细节,只会让我们对于分析产生莫须有的恐惧,因此一些“无关紧要“细节就被我们刻...
前面搜集了一些计算测序覆盖度和深度的方法,这次详细介绍下samtools如何解决了我的问题。 计算WGS/WES/panel捕获效率/覆盖度的方法有哪些:https://ww...
前言 cowplot 包是 ggplot 的一个简单插件,可以对多个图形进行排列和对齐,来生成复杂的出版级别的图片,还提供了一些主题和帮助函数。 安装 导入相关包 示例 1....
什么是基因组变异 基因组变异是一个定义比较模糊的概念. 所谓的变异是相对于一个完美的“参考基因组”而言。但是其实完美的“参考基因组”并不存在,因为我们只是选择某一个物种里的其...
(1)是什么?含义是什么? ,全称为fixation index,是一种用于衡量群体间分化程度的统计检验量(由Wright's F-statistics衍生而来)。 一般从S...
最近需要画LD block,之前一直用haploview软件画,haploview软件毛病比较多,比如不能有多态位点,输入的变异位点不能太多等。动不动就报错。 最近试了一下另...