1. 简介 subprocess 是 Python 的一个标准库，它允许你启动新的进程、连接到它们的输入/输出/错误管道，并且获取它们的返回值。该库使 Python 程序能够...
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subprocess：python中执行外部命令 -
Docker镜像换源（加速下载）
1、确认docker是否安装 或 2、确认docker服务名称（后面会用到） 确认 Docker 服务的正确名称。在基于 systemd 的系统中，可以使用以下命令查找所有 ...
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hydra--参数管理包
一、hydra的详细用法举例 Hydra 是一个用于构建复杂应用程序的配置框架，它允许你通过命令行参数、环境变量或配置文件来覆盖配置值。以下是 Hydra 在 Python ...
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pt是训练好的模型参数，同一个模型肯定是一样的。embedding的维度是一个固定的值比如1024，就是把不同氨基酸长度的蛋白最终都转换成了一个由1024个数字组成的向量。
用esm模型do蛋白 embedding
Github官方文档包含了整个包的所有代码及使用方法：Github官方文档：https://github.com/facebookresearch/esm[https://g...
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是的，当确定超参数13后，需要重新训练一遍模型作为最终使用的模型，这个时候可以不用验证和测试集了（至少验证集可以不用了），把验证集（和测试集）都作为训练集，这样能保证最终的模型有更多的样本进行训练，使模型泛化性能更好。我这里只是拿KNN做了示范，随机森林等其他方法是一样的。
单一验证、k折交叉验证（特例：留一法（LOOCV））、交叉验证确定最优超参数
一、单一验证 1、单一训练集和测试集 最简单的样本集划分就是只有训练集和测试集，而没有验证集，因此无法利用验证集反过来对模型参数进行调整。只能先给定一组超参数C，然后训练得到...
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★GPU、GPU驱动、CUDA、CUDA Toolkit、cuDNN的关系
https://haokan.baidu.com/v?pd=wisenatural&vid=9064106905869811204[https://haokan.baidu....
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nbextensions插件（重要）
该插件在linux下设置好后，在本地远程打开linux上的jupyter notebook后依然有效。 ★jupyter notebook版本过高（7及更高）会导致不支持nb...
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连续子图抽取：根据指定目标节点抽取连续子图k_hop_subgraph()当需要从一个图中抽取某一个或一系列节点（目标节点）周围的k级连续节点时，可以用PyG的 k_hop_subgraph() 方法。k=1：与目标节点直接相连的节点；k=2：与目...
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PyG构建图对象并转换成networkx图对象一、写在前面 PyG 是一款基于PyTorch 的图神经网络库，它提供了很多经典的图神经网络模型和图数据集。在使用 PyG 框架来构建和训练图网络模型时，需要事先将图数据换成...
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用esm模型do蛋白 embeddingGithub官方文档包含了整个包的所有代码及使用方法：Github官方文档：https://github.com/facebookresearch/esm[https://g...
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GridSearchCV() 与 Pipline相结合
GridSearchCV()或RandomizedSearchCV()方法的初级用法见：https://www.jianshu.com/writer#/notebooks/5...
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Pipeline 深入解读及实验
一、Pipeline基本知识 Pipeline 对象将不同计算步骤串联起来执行，方便、快速、统一、保险！ 构造一个Pipeline对象时，需要输入一个由多个二元tuple构成...
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GridSearchCV()和RandomizedSearchCV()参数搜索
一、具体例子见（jupyter notebook）： E:\cgx硬盘\★Python and AI\（cgx★★）scikit learn 学习笔记\sklearn_cgx...
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numpy 打印输出格式
为了随心所欲地打印numpy数组，可以使用numpy的set_printoptions()方法; 参数说明： precision：输出float型时，小数点后保留的位数； t...
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jupyter notebook 改变主题背景方法最基本步骤： 在cmd中执行 1） 安装jupyter-themes 2） 查看有哪些主题 如果jt命令不存在：https://cloud.tencent.com/devel...
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一个cell多个输出，不依靠print()
设置一个cell多个输出，不用print()也行。 jupyter notebook 的一个cell中，如果直接写多个对象，则只有最后一个对象会被输出，前面变量不会被输出： ...
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Git Github使用入门（说明：本文以windows系统为例进行说明，linux系统中使用类似；本文脚本都在本地Git Bash中执行；本文主要讲Git、Github的入门级使用。） Git是目前世...
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本地pycharm连接远程服务器的python解释器执行代码https://blog.csdn.net/qq_36667170/article/details/121716527[https://blog.csdn.net/qq_36...