RNAseq常规做法是先筛选出差异表达基因,然后针对筛选出来的差异基因做GO富集分析。 1.水稻、小麦GO信息提取 在进行GO富集分析前首先要确定在你所使用的GO富集分析软件...
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RNAseq常规做法是先筛选出差异表达基因,然后针对筛选出来的差异基因做GO富集分析。 1.水稻、小麦GO信息提取 在进行GO富集分析前首先要确定在你所使用的GO富集分析软件...
个人总结:GWAS是复杂性状相关基因定位的常用手段,其结果与参考基因组的选择有关,若多样性群体中的候选基因不存在于参考基因组,则无法鉴定。而Kmer-based GWAS则不...
分子层面对生物的研究,在个体水平上主要是看单个基因的变化以及全转录本的变化(RNA-seq);在对个体的研究的基础上,开始了群体水平的研究。如果说常规的遗传学主要的研究对象是...
Fst值的计算 群体间分化指数fst,取值范围0~1,值越大表明群体间分化程度越高,亲缘关系越远。 这个窗口大小和步长不影响结果 曼哈顿图 首先上传数据,每列数据类型都为数值...
前言 来到这里,已经渐渐不是人话了... 估计这辈子我也没有想到,我把我最厌恶的东西写出来, 居然是最多人看的...... 分析方法很多,这一小节吐槽官网的这一行代码,大神请...
概念 PCA(principal components analysis)即主成分分析。主成分分析也称主分量分析,旨在利用降维的思想,把多指标转化为少数几个综合指标。 在统计...