ubuntu,Linux系统都可以的
完整转录组RNAseq分析流程（tophat2+cufflink+cuffdiff）前一段时间跟着孟浩巍大神的视频学习，在自己的小破笔记本上还是跑完了整个RNAseq差异表达的分析流程（ tophat2 + cufflink + cuffdiff ）虽然这个...
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R（tidyverse包）常用操作
提取列 对列进行选择 select 函数 提取行 对行进行选择 filter 函数slice（）：按位置提取行filter（）：提取符合特定逻辑条件的行。 例如，iris％>...
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uniprot数据库就是这样的，蛋白差异比较小就归为同一种蛋白，对应到基因上就会出现一个蛋白对应到多个基因上
uniport ID 转换为 gene symbol（ID转换）
网站 ID转换网址[https://biodbnet-abcc.ncifcrf.gov/db/db2db.php] input 选择 uniprot accession ou...
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根据基因名称批量提取基因序列实验中经常需要从基因组中提取、序列用于设计引物，或者进行基因功能研究等，之前看到别人使用的一个脚本，自己拿来用一下，感觉确实很方便 在网站[http://hgdownload...
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@小茞 对的，没有变化的，卸载子系统也和普通卸载软件差不多
构建生物信息学环境-1（Win10 Linux子系统的安装）
生信的入门，如果实验室之前没有人从事生物信息学的师兄师姐的话，其实入门还是挺麻烦的，如果再不懂电脑，缺少各种东西，就会特别麻烦。想要做生信分析自然少不掉的就是自己搭建一个生信...
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@小茞 子系统另外一个角度来看和一个软件差不多，没有切换一说，子系统运行时，win系统也是运行的，没有特别大影响
构建生物信息学环境-1（Win10 Linux子系统的安装）
生信的入门，如果实验室之前没有人从事生物信息学的师兄师姐的话，其实入门还是挺麻烦的，如果再不懂电脑，缺少各种东西，就会特别麻烦。想要做生信分析自然少不掉的就是自己搭建一个生信...
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记录生信学习之路
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uniport ID 转换为 gene symbol（ID转换）网站 ID转换网址[https://biodbnet-abcc.ncifcrf.gov/db/db2db.php] input 选择 uniprot accession ou...
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samtools 序列比对率计算（samtools flagstat）准备序列比对后生成的 bam 文件或者 .sam 文件 结果解释从第一行至第十一行分别表示： QC pass的reads的数量为2499971，未通过QC的reads数量为0...
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bedtools 批量提取snp前后1000bp片段
准备条件1 知晓snp位置，位于第 x 条染色体上 12345678 bp2 生成 .txt 文件，文件格式如下 第一列表示 snp 染色体位置第二列表示 snp 前 50...
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GSEA笔记GSEA缩写 GSEA的全称是Gene Set Enrichment Analysis，中文翻译就是基因集富集分析，最早提出GSEA的文章是下面的这篇文献： 基因集富集分析是...
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@Ryan_hehe 这样应该也没有大问题
cuffdiff 产出文件说明（cuffdiff工具说明书）
这个文章详细说明了 cuffdiff 操作过程中各命令意义以及产出的文件代表什么意思，哪些是用于下一步做可视化分析和go富集分析,kegg富集分析等(ps:markdown写...
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@Ryan_hehe 应该是产生了可变剪切，这个要看你后续怎么分析了，一般算总量的话应该也不算错
cuffdiff 产出文件说明（cuffdiff工具说明书）
这个文章详细说明了 cuffdiff 操作过程中各命令意义以及产出的文件代表什么意思，哪些是用于下一步做可视化分析和go富集分析,kegg富集分析等(ps:markdown写...
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SSR (misa + primer3 ) 设计SSR引物
先下载 primer3 和 misa 相关文件 misa 相关文件放在百度云链接：https://pan.baidu.com/s/1C4eU30yyLr7iNGiuGEmPt...
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杂种指数（HI,hybridindex）计算
HI = 100×（Hi - Mi1）/（Mi2-Mi1）Hi ：杂交种平均值Mi1：母本平均值Mi2：父本平均值 HI 介于45-55之间属于中间性状HI < 45 为偏...
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我的生信入门1. 统计入门 作为生信的入门课程，统计学的学习比想象的更为重要《医学统计学（第三版）》李晓松主编，看完前几章的基础部分，可以搭配《白话统计》一起看，完成统计学入门。 2. ...
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