完美解决。
boost编译出错，找不到pyconfig.h问题 /boost/python/detail/wrap_python.hpp:50:23: fatal error: pyconfig.h No such file or ...
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如何对基因组序列进行注释基因组组装完成后，或者是完成了草图，就不可避免遇到一个问题，需要对基因组序列进行注释。注释之前首先得构建基因模型，有三种策略： 从头注释(de novo prediction...
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python 在vscode下自动补全
VS Code python自定义类或者函数Import后无自动补全提示 用VS code写python，标准模块自动补全都没有问题，在用自定义的module，import后...
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纯二代测序从头组装基因组基因组组装 基因组组装一般分为三个层次，contig, scaffold和chromosomes. contig表示从大规模测序得到的短读(reads)中找到的一致性序列。组...
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GO KEGG NR KOG Swissprot 注释，分类。
1.数据库的获取，其中NR,swissprot,go数据库是可以免费下载获得，KEGG数据库是明确需要收费的。2011年最后一个公开的免费版本。KOG还没注意。 2.虽然KE...
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目前做了一下验证，不能使用prefetch的ascp下载的话。和数据是有关系的 。有的数据就是只能用http下载。
SRA 数据下载自救指南
还在羡慕海峡那边的朋友下载SRA 快到飞起？还在难过用wget 下载数据经常下载不完整？用了官方的下载工具还是慢的不行？这里有一个SRA 下载自救尝试指南供你参考。 需要用到...
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大佬，大佬，都看懂了。茅塞顿开。特别是大片段和小片段的图解。
👍👍👍👍👍👍生信基础知识复习之测序
刘小泽写于18.11.25每学习一遍之前的知识，总能从不同角度获取一些观点，然后扩增自己的知识库，这就是“知识迭代”这次我也就是想到哪写到哪，把自己认为重要的内容梳理下，用Q...
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收录比较基因组学，进化基因组学，群体基因组学，分子进化，及相关领域的各类文章。特别地。由于是简书，建树的内容当然是必不可少了。 欢迎大家投稿
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个人博客: xuzhougeng.top (随缘访问)
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pb-assembly的使用与测试。
由于falcon的安装实在过于繁琐，一直使用的服务器上别人的falcon。然而PacBio官方在其官网的位置推荐使用最新的pb-assembly，于是便开始漫长的怕坑旅程。。...
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不要用这个工具去处理PB的三代数据。否则ID改变会引起falcon不识别。会报错。可以尝试pfastq-dump
都8102年了，还用fastq-dump，快换fasterq-dump吧
之前写过一篇文章Fastq-dump: 一个神奇的软件[https://www.jianshu.com/p/a8d70b66794c]， 详细介绍了fastq-dump的用法...
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@CrazyBoy_666 如果使用了长片段（三代数据）对基因组进行了polish，那么基因组的N50可能会发生变化。（长reads跨过了某些区域）。contig数目没有变化就没有问题。
使用nextpolish对三代组装进行polish
使用nextpolish对三代组装进行polish NextPolish是武汉未来组开发的一个三代基因组polish工具（另外一个常用软件是Pilon）。NextPolish...
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如果你是程序员，或者有一颗喜欢写程序的心，喜欢分享技术干货、项目经验、程序员日常囧事等等，欢迎投稿《程序员》专题。 专题主编：小彤花园 http://www.jianshu.com/users/4a4eb4feee62/ 【程序员】专题拒稿指北：http://www.jianshu.com/p/7c8b33b5f63b 投稿须知： 1.收录相关技术文章，但不限于技术，也可以是项目经验类的文章和程序员日常。 2.文章內不得有任何推广信息。包括但不限于公众号、微博、微信，更不得在通过投稿后再修改文章加入推广信息。你可以将这些推广以及个人信息放在个人主页介绍里。 3.字数极少，段落混乱，大段代码没有放到代码框的文章不收录 4.不相关的内容不收录，请确认文章内容和本专题相关 目前针对优质作者及爱好者，开设了官方程序员微信群，希望加入请发简信给主编小彤花园索取个人微信，主编会将你加入到【程序员】微信群，分享内容，收获知识。添加微信时备注昵称。
