在上一篇笔记里，练习了使用cellranger aggr整合不同GEM well的样品（cellranger使用的初步探索（3）cellranger aggr），得到的"ou...
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cellranger使用的初步探索（4）：R读取cellranger的输出文件 -
scRNAseq双细胞去除-1: DoubletFinder10x平台的双细胞率（符合泊松分布1）： 根据Poisson分布，单个液滴包含超过一个细胞（doublets或multiplets）的频率随着上机细胞的浓度而改变。通常如果上...
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单细胞转录组建库原理：SMART、TargetAmp和10X genomics要实现单细胞mRNA测序，需要解决2个难题：1. 一个人类细胞中，RNA总量大约只有10pg左右（1pg=10-12g），其中mRNA的量大约只有0.2pg。要把这么少的mR...
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随机森林的树是否越多越好？
面试时被问到在随机森林的树是否数量越多越好？开始只考虑构建更多的树一来浪费资源，二来数量一定后模型的性能基本保持稳定，随着树的增加提升非常小。回来后又想了想，随机森林中通过引...
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随机森林中oob以及oob的作用？
在随机森林bagging法中可以发现booststrap每次约有1/3的样本不会出现在bootstrap所采集的样本集合中，故没有参加决策树的建立，这些数据称为袋外数据oob...
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跟着Nature Communication学数据分析：R语言利用宏基因组的相对丰度数据做主坐标分析（PcoA)）论文 Microbiomes in the Challenger Deep slope and bottom-axis sediments https://www.natur...
