森言森语 眼看着十一月又到中旬，时间是过得真快。一个多月没怎么写东西了，实际上是有些懒。 这不马上就要开题论证了，听说定量是最受学生喜爱的实验了。 于是我也准备赶在开题之前在...
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批量设计qPCR引物，可最大限度满足qPCR引物设计的黄金法则 -
qPCR引物设计与验证引物设计是 qPCR[https://www.biomart.cn/supply/10010115.htm] 非常重要的环节。今天小编给大家推荐 2 款简单实用的在线 qPC...
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使用TBtools提取基因组CDS并转换成蛋白文件基因功能注释需要蛋白文件，有时候注释或下载的基因组没有蛋白文件，需提取并转换，据师兄师弟说gffread提取结果有问题，可能造成移码等，因此使用TBtools进行提取并转...
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Window下如何下载SRA数据跑DADA2流程由于没有服务器，只能自己捣鼓着用windows的cmd命令行来批量下载一些数据，但是windows下高通量测序数据（如sra）下载体验真的很差，没办法，只能硬着头皮去搞 一、...
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如何下载sra数据，转化fastq进行分析
前言 本文分享如何从NCBI数据库下载我们需要的数据，进行我们自己的数据分析。该过程的思路相对清晰，主要需要完成以下三个步骤。 1. SRA ID 号查询 1.1. 我们需要...
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RPKM、FPKM、TPM详解
简写 RPKM: Reads Per Kilobase of exon model per Million mapped reads (每千个碱基的转录每百万映射读取的rea...
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[实战1] Polycomb associates genome-wide with a specific RNA polymerase II variant, and regulates me...写在前面：参考-# 给学徒ChIP-seq数据处理流程[https://www.jianshu.com/p/1384173c353b] 目录软件安装[https://www....
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实用！便携且高效 去除 基因组序列和注释 碎片写在前面 目前，有大量物种的基因组序列和注释信息公布。几乎所有科研人员都可以下载并使用这些数据，分析和验证自己的科研假设。常常，我们会遇到一些小问题，比如基因组序列文件中包含...
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物种间共线性circos——作图步骤早先写过，但是有不少朋友还是在后台留言，无法完全重复。我仔细看了之后发现，的确是我在有些细节上写的不够详细。但是不想去完善了。毕竟tbtools的实现逻辑已经很简单了。 那就...
