写在前面:非常感谢CJ开发出如此强大的TBtools工具,作者详细讲解了基因家族的分析过程和意义,课程购买地址,讲的很棒,可以试听。 一共分为4个部分TBtools基因家族分...
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基本分析内容 • 基因家族概念• 数据库检索与成员鉴定• 蛋白成员基本特性和基因结构分析• 多序列比对和进化树分析• 保守结构域和模体分析(motif注释...
参考方法:https://www.bio-protocol.org/bio101/e1010133[https://www.bio-protocol.org/bio101/e...
| Database | URL | Species || RARTF | http://rarge.gsc.riken.jp/rartf/ | 拟南芥 || AGRIS, ...
本文介绍了基因、蛋白、引物、载体、限制酶切位点、酶、微生物的命名规则。由于涉及领域宏大,全面的细则以报告或文件的形式发表,本文只是对各类的命名做形而上的简介,同时融合了笔者的...
文章仅是记录自己的学习使用,有错误请指出,我立刻改正! 更多说明:https://www.jianshu.com/p/f80398cb9c97[https://www.jia...
来自俄罗斯研究人员开发了基因转录调控数据库:GTRD(Gene Transcription Regulation Database),为转录调控研究提供最全面的ChIP-se...
什么是转录因子? 如何寻找转录因子? 转录因子的功能是什么? 如何确定转录因子的结合位点? 提起转录因子,该有一堆问题冒出来。 定义与功能 转录因子(Transcriptio...
准备文件: ——萝卜蛋白序列(你自身研究物种的蛋白序列);rs.tree,它是Clustal OmeGA跑出来的;特定gff文件,格式为第一列是染色体,第二列基因ID,第三列...
单细胞 CUT&Tag 分析 随着10X、BD等平台技术的推进,单细胞层面解析表达和开放染色质水平的研究方法已经得到很好的建立,并且在动植物种中都得到了很好的尝试。 对于研究...
写在前面 不少人应该知道,在生物模式,通路,调控机制上,PPT 已然是常规工具之一。类似的,那么画卡通热图,PPT一样靠谱。我们知道,Adobe Illustrator 和 ...
当你在研究一个基因时,你应该首先应该知道这个基因的研究的进展,如该基因是否是个与癌症相关基因,它在各种细胞系或者组织中的表达,它的产物能与哪些蛋白质相互作用,参与了哪些细胞通...
欢迎关注R语言数据分析指南 最近在做一个基因家族的数据分析,整理了一下以前的笔记,本节通过水稻的案例来介绍如何计算该物种旁系同源基因的ka/ks值 软件安装 数据下载 除了上...