1. Cre-loxp系统及其应用介绍 Cre-loxp系统源于P1噬菌体的高效重组系统。Cre (Causes recombination; Cyclization rec...
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Cre小鼠的简介与应用 -
Counts FPKM RPKM TPM CPM 的转化
一、什么是RPKM、 FPKM、TPM、CPM RPKM, FPKM and TPM, clearly explained - StatQuest!!
解决Mac能上微信聊QQ但是打不开网页的问题公司搬了一下办公室之后，然后我们的网络就出现了各种问题，第一时间我把公司的网络调节正常了，能上网了，但是突然到了下午的时候Mac打不开网页了，就像下面这个样子 然后我在网上也...
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张泽民老师系列文章解读(三)说在前面 我们在前两期推文：张泽民老师系列文章解读(一)[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI4MjY5ODI1Nw==&mid=2247...
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团队作案HEK293，史上最强搬砖细胞293细胞不是一个人在战斗 对于做分子生物学实验的人来说，293细胞再熟悉不过了。常在文献中看到不同的293名字，全然没考虑过293细胞原来还是团队作案，分身无数。 293细...
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一文了解Count、FPKM、RPKM、TPM | 相互间的转化 | 收藏教程
PS：如果你需要本教程的练习代码和文档，可以在公众号回复“20220122”即可获得。 前言： 今早看到一篇博文，提到了FPKM与TPM间转化。我自己也系统的再次进行整理一下...
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基因功能富集一 基础知识 1、什么是富集分析？ 富集分析的原理一个生物过程通常是由一组基因共同参与，而不是由单个基因独自完成。富集分析的基本前提假设是，如果一个生物学过程在已知的研究中发...
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ChIP-seq和CUT&Tag技术ChIP-seq：利用染色质免疫共沉淀 + 高通量测序研究某种蛋白质结合的基因组区域 1. 甲醛交联：将所有蛋白和其结合的DNA固定下来 2. 染色质片段化：裂解细胞、DNA...
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CUT&Tag的分析——demo重复其他拓展阅读 https://www.jianshu.com/p/27e91c8dac2f[https://www.jianshu.com/p/27e91c8dac2f] #...
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防止电脑宕机的学习笔记备份夹<br>
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GO/KEGG富集分析及R包绘图（气泡图/条形图）导读 利用富集分析，我们可以把很多看着杂乱的差异基因总结出一个比较整体反应事件发生的概述性的句子。 例如：TP53信号通路和胃癌的发生有关。而不是说BAX、BID、ABL1、...
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还在为ID转换发愁吗？
在我们处理GEO数据时，最复杂的就是ID转换。有一些GPL平台的注释在R包，就可以直接调取进行转换，而很多新的GPL平台注释信息没有在R包中，需要我们在GEO下载频台注释信息...
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一文解决GEO芯片数据分析80％的工作！建议收藏！
你不得不知道的GEO数据库芯片数据分析方法 大家好，我是阿琛。今天来给大家介绍一个新的专题内容---GEO数据库的使用方法。烹饪需要食材，分析需要数据。数据出发，整个研究的第...
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单细胞CNS文章复现Single-cell profiling of tumor heterogeneity and the microenvironment in advanced non-s...今天要复现的这篇文献来自新鲜出炉的NC。 这篇是关于肺癌的。作者通过对42例晚期肺癌进行单细胞测序，描绘了晚期肺癌的单细胞微环境图谱，为肺癌的精准靶向治疗提供了有益参考。 要...
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单细胞108篇文献解读之14---Single-Cell Deconvolution of Fibroblast Heterogeneity in Mouse Pulmonary Fibrosis单细胞转录组测序没你想的那么复杂，小的样本量即可搞定 昨天我们总结了单细胞转录组的部分研究策略，其中提到了一项研究思路：“药物处理前后/诱导前后细胞转录组变化”，从这个思路中...
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单细胞SCENIC分析原理和流程介绍SCENIC官网：https://rawcdn.githack.com/aertslab/SCENIC/701cc7cc4ac762b91479b3bd2eaf5ad5661...
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GSEA学习笔记Gene set enrichment analysis, 基因集富集分析 1、算法思想 对某基因Knock down和WT做差异表达分析之后，得到差异表达基因list，按照...
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【铁死亡>>预后模型】01.随机森林+PCA+LUAD（4+分）PMID: 杂志：Frontiers in Molecular Biosciences 知识点 36个铁死亡相关基因[https://pubmed.ncbi.nlm.nih....
