写在前面 目前,github 应是生信软件摆放的主流仓库。比如我们熟悉的TBtools, Seqkit,IGV等等。当然,甚至很多时候,我们会发现一些高水平的分析类文章直接讲...

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今天继续 跟着Nature Communications学画图系列第四篇。学习R语言ggplot2包画散点图,然后分组添加拟合曲线。对应的是论文中的Figure2 对应的 N...
samtools用conda 刚安好是可用的,但是装了其他一些软件后就有可能报错 解决方案: 原理 这个问题在github issue中很多人提到,samtools开发者说这...
载入数据 mycounts<-read.csv("2020武汉加油.csv")head(mycounts)rownames(mycounts)<-mycounts[,1]my...
HOMER 是一套用于Motif查找和二代数据分析的工具。hommer结果中一般包含已知motif富集情况,并且也会对用户提供的序列进行重头预测motif。 很多同学在拿到这...
前面介绍了怎么一行命令完成RNAseq差异分析加作图,那如果我们已经有自己重点关注的基因,并且想把这些基因在差异结果里展示出来怎么弄呢? 今天再来介绍一下,做完差异分析之后怎...
写在前面的话 你既然点进来了,说明你多半用过这个软件。但我猜,大多数人早期使用这个软件的时候,一定是赶鸭子上架:因为要画图,所以必须会。 但你真的懂了么? 太长不看系列 对于...
ref1:deeptools辅助CHIP-seq数据分析-可视化 | 生信菜鸟团 ref2:如何使用deeptools处理BAM数据 - 生信技能树 ref3:The too...
刘小泽开始写于19.7.31写这个是因为看到龙星教程使用了大量的perl脚本,动辄4、5千行,例如https://github.com/WGLab/PennCNV/blob/...