写在前面 目前，github 应是生信软件摆放的主流仓库。比如我们熟悉的TBtools， Seqkit，IGV等等。当然，甚至很多时候，我们会发现一些高水平的分析类文章直接讲...
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神器！| 加速访问 github ，加速你的科研 -
跟着Nature Communications 学画图~ggplot2散点图分组添加拟合曲线今天继续 跟着Nature Communications学画图系列第四篇。学习R语言ggplot2包画散点图，然后分组添加拟合曲线。对应的是论文中的Figure2 对应的 N...
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【已解决】samtools报错error while loading shared libraries: libcrypto.so.1.0.0
samtools用conda 刚安好是可用的，但是装了其他一些软件后就有可能报错 解决方案： 原理 这个问题在github issue中很多人提到，samtools开发者说这...
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【原创】R语言实战：read counts如何转化为TPM和FPKM, TPM和FPKM相互转化
载入数据 mycounts<-read.csv("2020武汉加油.csv")head(mycounts)rownames(mycounts)<-mycounts[,1]my...
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ChIP-Seq数据挖掘系列-6: 怎么选择HOMMER结果中的motif
HOMER 是一套用于Motif查找和二代数据分析的工具。hommer结果中一般包含已知motif富集情况，并且也会对用户提供的序列进行重头预测motif。 很多同学在拿到这...
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一行命令完成RNAseq数据标记重要基因
前面介绍了怎么一行命令完成RNAseq差异分析加作图，那如果我们已经有自己重点关注的基因，并且想把这些基因在差异结果里展示出来怎么弄呢？ 今天再来介绍一下，做完差异分析之后怎...
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你考虑过computeMatrix的工作原理么?写在前面的话 你既然点进来了，说明你多半用过这个软件。但我猜，大多数人早期使用这个软件的时候，一定是赶鸭子上架：因为要画图，所以必须会。 但你真的懂了么？ 太长不看系列 对于...
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deeptools可视化ref1：deeptools辅助CHIP-seq数据分析-可视化 | 生信菜鸟团 ref2：如何使用deeptools处理BAM数据 - 生信技能树 ref3：The too...
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生信~一天学会Perl，你相信吗？刘小泽开始写于19.7.31写这个是因为看到龙星教程使用了大量的perl脚本，动辄4、5千行，例如https://github.com/WGLab/PennCNV/blob/...
